Protein–RNA interactions for Protein: Q52WX2

SBK1, Serine/threonine-protein kinase SBK1, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBK1Q52WX2 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SBK1Q52WX2 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SBK1Q52WX2 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SBK1Q52WX2 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SBK1Q52WX2 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SBK1Q52WX2 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SBK1Q52WX2 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SBK1Q52WX2 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SBK1Q52WX2 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SBK1Q52WX2 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SBK1Q52WX2 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SBK1Q52WX2 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SBK1Q52WX2 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SBK1Q52WX2 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SBK1Q52WX2 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SBK1Q52WX2 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SBK1Q52WX2 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SBK1Q52WX2 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SBK1Q52WX2 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SBK1Q52WX2 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SBK1Q52WX2 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SBK1Q52WX2 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SBK1Q52WX2 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SBK1Q52WX2 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SBK1Q52WX2 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SBK1Q52WX2 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SBK1Q52WX2 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SBK1Q52WX2 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SBK1Q52WX2 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SBK1Q52WX2 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SBK1Q52WX2 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SBK1Q52WX2 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SBK1Q52WX2 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SBK1Q52WX2 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SBK1Q52WX2 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SBK1Q52WX2 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SBK1Q52WX2 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SBK1Q52WX2 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SBK1Q52WX2 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SBK1Q52WX2 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SBK1Q52WX2 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SBK1Q52WX2 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SBK1Q52WX2 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SBK1Q52WX2 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SBK1Q52WX2 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SBK1Q52WX2 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SBK1Q52WX2 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SBK1Q52WX2 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SBK1Q52WX2 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SBK1Q52WX2 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SBK1Q52WX2 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SBK1Q52WX2 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SBK1Q52WX2 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SBK1Q52WX2 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SBK1Q52WX2 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SBK1Q52WX2 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SBK1Q52WX2 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SBK1Q52WX2 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SBK1Q52WX2 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SBK1Q52WX2 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SBK1Q52WX2 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SBK1Q52WX2 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SBK1Q52WX2 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SBK1Q52WX2 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SBK1Q52WX2 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SBK1Q52WX2 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SBK1Q52WX2 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SBK1Q52WX2 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SBK1Q52WX2 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SBK1Q52WX2 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SBK1Q52WX2 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SBK1Q52WX2 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SBK1Q52WX2 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SBK1Q52WX2 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SBK1Q52WX2 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SBK1Q52WX2 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SBK1Q52WX2 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SBK1Q52WX2 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SBK1Q52WX2 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SBK1Q52WX2 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SBK1Q52WX2 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SBK1Q52WX2 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SBK1Q52WX2 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SBK1Q52WX2 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SBK1Q52WX2 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SBK1Q52WX2 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SBK1Q52WX2 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SBK1Q52WX2 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SBK1Q52WX2 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SBK1Q52WX2 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SBK1Q52WX2 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SBK1Q52WX2 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SBK1Q52WX2 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SBK1Q52WX2 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SBK1Q52WX2 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SBK1Q52WX2 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SBK1Q52WX2 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SBK1Q52WX2 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SBK1Q52WX2 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SBK1Q52WX2 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms