Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXY8

ARL13B, ADP-ribosylation factor-like protein 13B, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL13BQ3SXY8 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARL13BQ3SXY8 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARL13BQ3SXY8 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARL13BQ3SXY8 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARL13BQ3SXY8 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARL13BQ3SXY8 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARL13BQ3SXY8 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARL13BQ3SXY8 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARL13BQ3SXY8 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARL13BQ3SXY8 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ARL13BQ3SXY8 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARL13BQ3SXY8 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARL13BQ3SXY8 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARL13BQ3SXY8 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARL13BQ3SXY8 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARL13BQ3SXY8 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARL13BQ3SXY8 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARL13BQ3SXY8 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARL13BQ3SXY8 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ARL13BQ3SXY8 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARL13BQ3SXY8 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARL13BQ3SXY8 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARL13BQ3SXY8 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARL13BQ3SXY8 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARL13BQ3SXY8 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARL13BQ3SXY8 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARL13BQ3SXY8 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARL13BQ3SXY8 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARL13BQ3SXY8 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARL13BQ3SXY8 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARL13BQ3SXY8 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARL13BQ3SXY8 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARL13BQ3SXY8 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARL13BQ3SXY8 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARL13BQ3SXY8 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ARL13BQ3SXY8 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARL13BQ3SXY8 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARL13BQ3SXY8 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARL13BQ3SXY8 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ARL13BQ3SXY8 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ARL13BQ3SXY8 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARL13BQ3SXY8 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARL13BQ3SXY8 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARL13BQ3SXY8 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARL13BQ3SXY8 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARL13BQ3SXY8 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARL13BQ3SXY8 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARL13BQ3SXY8 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ARL13BQ3SXY8 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARL13BQ3SXY8 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARL13BQ3SXY8 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARL13BQ3SXY8 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARL13BQ3SXY8 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ARL13BQ3SXY8 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARL13BQ3SXY8 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARL13BQ3SXY8 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARL13BQ3SXY8 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARL13BQ3SXY8 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARL13BQ3SXY8 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARL13BQ3SXY8 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARL13BQ3SXY8 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARL13BQ3SXY8 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARL13BQ3SXY8 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARL13BQ3SXY8 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARL13BQ3SXY8 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARL13BQ3SXY8 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARL13BQ3SXY8 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARL13BQ3SXY8 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARL13BQ3SXY8 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ARL13BQ3SXY8 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARL13BQ3SXY8 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARL13BQ3SXY8 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARL13BQ3SXY8 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARL13BQ3SXY8 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARL13BQ3SXY8 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARL13BQ3SXY8 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARL13BQ3SXY8 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARL13BQ3SXY8 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARL13BQ3SXY8 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARL13BQ3SXY8 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARL13BQ3SXY8 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARL13BQ3SXY8 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARL13BQ3SXY8 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARL13BQ3SXY8 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARL13BQ3SXY8 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARL13BQ3SXY8 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARL13BQ3SXY8 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARL13BQ3SXY8 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARL13BQ3SXY8 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ARL13BQ3SXY8 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARL13BQ3SXY8 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARL13BQ3SXY8 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARL13BQ3SXY8 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARL13BQ3SXY8 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARL13BQ3SXY8 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARL13BQ3SXY8 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARL13BQ3SXY8 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARL13BQ3SXY8 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARL13BQ3SXY8 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARL13BQ3SXY8 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms