Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLHL38Q2WGJ6 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLHL38Q2WGJ6 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLHL38Q2WGJ6 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLHL38Q2WGJ6 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLHL38Q2WGJ6 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLHL38Q2WGJ6 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLHL38Q2WGJ6 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
KLHL38Q2WGJ6 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLHL38Q2WGJ6 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLHL38Q2WGJ6 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLHL38Q2WGJ6 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLHL38Q2WGJ6 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLHL38Q2WGJ6 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLHL38Q2WGJ6 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLHL38Q2WGJ6 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLHL38Q2WGJ6 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLHL38Q2WGJ6 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLHL38Q2WGJ6 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLHL38Q2WGJ6 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
KLHL38Q2WGJ6 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
KLHL38Q2WGJ6 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLHL38Q2WGJ6 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLHL38Q2WGJ6 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
KLHL38Q2WGJ6 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLHL38Q2WGJ6 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
KLHL38Q2WGJ6 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLHL38Q2WGJ6 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLHL38Q2WGJ6 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLHL38Q2WGJ6 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLHL38Q2WGJ6 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLHL38Q2WGJ6 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLHL38Q2WGJ6 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
KLHL38Q2WGJ6 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLHL38Q2WGJ6 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLHL38Q2WGJ6 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLHL38Q2WGJ6 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
KLHL38Q2WGJ6 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KLHL38Q2WGJ6 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KLHL38Q2WGJ6 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KLHL38Q2WGJ6 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KLHL38Q2WGJ6 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KLHL38Q2WGJ6 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KLHL38Q2WGJ6 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KLHL38Q2WGJ6 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
KLHL38Q2WGJ6 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
KLHL38Q2WGJ6 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
KLHL38Q2WGJ6 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
KLHL38Q2WGJ6 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
KLHL38Q2WGJ6 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KLHL38Q2WGJ6 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
KLHL38Q2WGJ6 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
KLHL38Q2WGJ6 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
KLHL38Q2WGJ6 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KLHL38Q2WGJ6 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHL38Q2WGJ6 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHL38Q2WGJ6 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHL38Q2WGJ6 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHL38Q2WGJ6 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHL38Q2WGJ6 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHL38Q2WGJ6 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHL38Q2WGJ6 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHL38Q2WGJ6 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHL38Q2WGJ6 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHL38Q2WGJ6 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHL38Q2WGJ6 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHL38Q2WGJ6 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHL38Q2WGJ6 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHL38Q2WGJ6 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHL38Q2WGJ6 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHL38Q2WGJ6 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHL38Q2WGJ6 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHL38Q2WGJ6 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHL38Q2WGJ6 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHL38Q2WGJ6 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLHL38Q2WGJ6 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLHL38Q2WGJ6 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLHL38Q2WGJ6 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLHL38Q2WGJ6 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLHL38Q2WGJ6 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLHL38Q2WGJ6 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLHL38Q2WGJ6 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLHL38Q2WGJ6 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLHL38Q2WGJ6 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLHL38Q2WGJ6 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLHL38Q2WGJ6 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLHL38Q2WGJ6 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLHL38Q2WGJ6 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
KLHL38Q2WGJ6 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLHL38Q2WGJ6 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLHL38Q2WGJ6 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLHL38Q2WGJ6 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLHL38Q2WGJ6 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLHL38Q2WGJ6 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLHL38Q2WGJ6 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLHL38Q2WGJ6 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLHL38Q2WGJ6 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLHL38Q2WGJ6 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLHL38Q2WGJ6 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLHL38Q2WGJ6 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms