Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

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Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL24A1Q17RW2 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL24A1Q17RW2 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL24A1Q17RW2 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL24A1Q17RW2 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL24A1Q17RW2 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL24A1Q17RW2 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL24A1Q17RW2 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
COL24A1Q17RW2 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
COL24A1Q17RW2 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
COL24A1Q17RW2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
COL24A1Q17RW2 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
COL24A1Q17RW2 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
COL24A1Q17RW2 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
COL24A1Q17RW2 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
COL24A1Q17RW2 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
COL24A1Q17RW2 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
COL24A1Q17RW2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
COL24A1Q17RW2 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
COL24A1Q17RW2 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
COL24A1Q17RW2 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL24A1Q17RW2 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL24A1Q17RW2 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL24A1Q17RW2 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL24A1Q17RW2 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL24A1Q17RW2 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
COL24A1Q17RW2 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
COL24A1Q17RW2 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL24A1Q17RW2 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL24A1Q17RW2 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL24A1Q17RW2 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL24A1Q17RW2 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL24A1Q17RW2 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL24A1Q17RW2 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
COL24A1Q17RW2 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL24A1Q17RW2 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL24A1Q17RW2 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL24A1Q17RW2 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL24A1Q17RW2 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL24A1Q17RW2 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
COL24A1Q17RW2 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL24A1Q17RW2 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL24A1Q17RW2 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL24A1Q17RW2 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL24A1Q17RW2 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL24A1Q17RW2 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL24A1Q17RW2 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL24A1Q17RW2 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL24A1Q17RW2 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL24A1Q17RW2 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL24A1Q17RW2 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL24A1Q17RW2 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL24A1Q17RW2 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
COL24A1Q17RW2 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL24A1Q17RW2 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
COL24A1Q17RW2 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL24A1Q17RW2 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
COL24A1Q17RW2 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL24A1Q17RW2 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL24A1Q17RW2 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL24A1Q17RW2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.56
COL24A1Q17RW2 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
COL24A1Q17RW2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COL24A1Q17RW2 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
COL24A1Q17RW2 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
COL24A1Q17RW2 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
COL24A1Q17RW2 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
COL24A1Q17RW2 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
COL24A1Q17RW2 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COL24A1Q17RW2 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COL24A1Q17RW2 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COL24A1Q17RW2 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COL24A1Q17RW2 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COL24A1Q17RW2 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
COL24A1Q17RW2 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COL24A1Q17RW2 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
COL24A1Q17RW2 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
COL24A1Q17RW2 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
COL24A1Q17RW2 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
COL24A1Q17RW2 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
COL24A1Q17RW2 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
COL24A1Q17RW2 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COL24A1Q17RW2 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
COL24A1Q17RW2 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COL24A1Q17RW2 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COL24A1Q17RW2 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
COL24A1Q17RW2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COL24A1Q17RW2 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
COL24A1Q17RW2 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
COL24A1Q17RW2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COL24A1Q17RW2 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
COL24A1Q17RW2 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COL24A1Q17RW2 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
COL24A1Q17RW2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COL24A1Q17RW2 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
COL24A1Q17RW2 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
COL24A1Q17RW2 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COL24A1Q17RW2 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COL24A1Q17RW2 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
COL24A1Q17RW2 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
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