Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLPPQ16740 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLPPQ16740 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLPPQ16740 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CLPPQ16740 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CLPPQ16740 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLPPQ16740 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLPPQ16740 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLPPQ16740 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLPPQ16740 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLPPQ16740 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLPPQ16740 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CLPPQ16740 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLPPQ16740 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLPPQ16740 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLPPQ16740 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLPPQ16740 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLPPQ16740 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLPPQ16740 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLPPQ16740 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLPPQ16740 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLPPQ16740 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLPPQ16740 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLPPQ16740 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLPPQ16740 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLPPQ16740 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CLPPQ16740 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLPPQ16740 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLPPQ16740 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLPPQ16740 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLPPQ16740 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLPPQ16740 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLPPQ16740 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLPPQ16740 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CLPPQ16740 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLPPQ16740 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLPPQ16740 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLPPQ16740 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLPPQ16740 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLPPQ16740 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLPPQ16740 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CLPPQ16740 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLPPQ16740 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLPPQ16740 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLPPQ16740 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLPPQ16740 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLPPQ16740 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLPPQ16740 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLPPQ16740 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLPPQ16740 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CLPPQ16740 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLPPQ16740 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CLPPQ16740 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CLPPQ16740 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLPPQ16740 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLPPQ16740 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLPPQ16740 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLPPQ16740 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLPPQ16740 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CLPPQ16740 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLPPQ16740 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLPPQ16740 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLPPQ16740 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLPPQ16740 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CLPPQ16740 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CLPPQ16740 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CLPPQ16740 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CLPPQ16740 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CLPPQ16740 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CLPPQ16740 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CLPPQ16740 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CLPPQ16740 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CLPPQ16740 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CLPPQ16740 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CLPPQ16740 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CLPPQ16740 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CLPPQ16740 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CLPPQ16740 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CLPPQ16740 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CLPPQ16740 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CLPPQ16740 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CLPPQ16740 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CLPPQ16740 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CLPPQ16740 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CLPPQ16740 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CLPPQ16740 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CLPPQ16740 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CLPPQ16740 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CLPPQ16740 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CLPPQ16740 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CLPPQ16740 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CLPPQ16740 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CLPPQ16740 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CLPPQ16740 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CLPPQ16740 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CLPPQ16740 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CLPPQ16740 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CLPPQ16740 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CLPPQ16740 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CLPPQ16740 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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