Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NRF1Q16656 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NRF1Q16656 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NRF1Q16656 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NRF1Q16656 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NRF1Q16656 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NRF1Q16656 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NRF1Q16656 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NRF1Q16656 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NRF1Q16656 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NRF1Q16656 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NRF1Q16656 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NRF1Q16656 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NRF1Q16656 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NRF1Q16656 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NRF1Q16656 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NRF1Q16656 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NRF1Q16656 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NRF1Q16656 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NRF1Q16656 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NRF1Q16656 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NRF1Q16656 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NRF1Q16656 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NRF1Q16656 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NRF1Q16656 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NRF1Q16656 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NRF1Q16656 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NRF1Q16656 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NRF1Q16656 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NRF1Q16656 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NRF1Q16656 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NRF1Q16656 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NRF1Q16656 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NRF1Q16656 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NRF1Q16656 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NRF1Q16656 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NRF1Q16656 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NRF1Q16656 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NRF1Q16656 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NRF1Q16656 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NRF1Q16656 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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NRF1Q16656 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NRF1Q16656 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NRF1Q16656 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NRF1Q16656 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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NRF1Q16656 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NRF1Q16656 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NRF1Q16656 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
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NRF1Q16656 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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NRF1Q16656 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NRF1Q16656 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NRF1Q16656 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NRF1Q16656 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NRF1Q16656 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NRF1Q16656 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NRF1Q16656 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
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NRF1Q16656 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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NRF1Q16656 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
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