Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NTRK2Q16620 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NTRK2Q16620 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NTRK2Q16620 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NTRK2Q16620 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NTRK2Q16620 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NTRK2Q16620 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NTRK2Q16620 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NTRK2Q16620 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NTRK2Q16620 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NTRK2Q16620 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NTRK2Q16620 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NTRK2Q16620 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NTRK2Q16620 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NTRK2Q16620 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NTRK2Q16620 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NTRK2Q16620 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NTRK2Q16620 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NTRK2Q16620 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NTRK2Q16620 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NTRK2Q16620 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NTRK2Q16620 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NTRK2Q16620 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NTRK2Q16620 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NTRK2Q16620 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NTRK2Q16620 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NTRK2Q16620 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NTRK2Q16620 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NTRK2Q16620 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NTRK2Q16620 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NTRK2Q16620 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NTRK2Q16620 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NTRK2Q16620 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NTRK2Q16620 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NTRK2Q16620 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NTRK2Q16620 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NTRK2Q16620 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NTRK2Q16620 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NTRK2Q16620 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NTRK2Q16620 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NTRK2Q16620 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NTRK2Q16620 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NTRK2Q16620 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NTRK2Q16620 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NTRK2Q16620 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NTRK2Q16620 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NTRK2Q16620 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NTRK2Q16620 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NTRK2Q16620 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NTRK2Q16620 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NTRK2Q16620 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NTRK2Q16620 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NTRK2Q16620 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NTRK2Q16620 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NTRK2Q16620 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NTRK2Q16620 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NTRK2Q16620 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NTRK2Q16620 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NTRK2Q16620 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NTRK2Q16620 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NTRK2Q16620 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NTRK2Q16620 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NTRK2Q16620 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NTRK2Q16620 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NTRK2Q16620 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NTRK2Q16620 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NTRK2Q16620 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NTRK2Q16620 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NTRK2Q16620 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NTRK2Q16620 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NTRK2Q16620 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NTRK2Q16620 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NTRK2Q16620 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NTRK2Q16620 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NTRK2Q16620 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NTRK2Q16620 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NTRK2Q16620 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NTRK2Q16620 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NTRK2Q16620 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NTRK2Q16620 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NTRK2Q16620 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NTRK2Q16620 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NTRK2Q16620 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NTRK2Q16620 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NTRK2Q16620 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NTRK2Q16620 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NTRK2Q16620 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NTRK2Q16620 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NTRK2Q16620 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NTRK2Q16620 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NTRK2Q16620 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NTRK2Q16620 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NTRK2Q16620 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NTRK2Q16620 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NTRK2Q16620 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NTRK2Q16620 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NTRK2Q16620 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NTRK2Q16620 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NTRK2Q16620 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NTRK2Q16620 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
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