Protein–RNA interactions for Protein: Q16570

ACKR1, Atypical chemokine receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR1Q16570 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACKR1Q16570 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACKR1Q16570 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACKR1Q16570 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACKR1Q16570 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACKR1Q16570 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACKR1Q16570 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACKR1Q16570 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACKR1Q16570 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACKR1Q16570 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACKR1Q16570 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACKR1Q16570 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACKR1Q16570 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACKR1Q16570 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACKR1Q16570 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACKR1Q16570 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACKR1Q16570 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACKR1Q16570 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACKR1Q16570 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACKR1Q16570 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACKR1Q16570 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACKR1Q16570 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACKR1Q16570 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ACKR1Q16570 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACKR1Q16570 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACKR1Q16570 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACKR1Q16570 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACKR1Q16570 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ACKR1Q16570 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACKR1Q16570 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACKR1Q16570 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACKR1Q16570 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACKR1Q16570 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACKR1Q16570 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACKR1Q16570 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACKR1Q16570 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACKR1Q16570 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACKR1Q16570 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACKR1Q16570 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACKR1Q16570 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACKR1Q16570 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACKR1Q16570 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACKR1Q16570 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACKR1Q16570 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACKR1Q16570 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACKR1Q16570 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACKR1Q16570 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACKR1Q16570 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACKR1Q16570 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ACKR1Q16570 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACKR1Q16570 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACKR1Q16570 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ACKR1Q16570 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACKR1Q16570 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACKR1Q16570 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACKR1Q16570 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACKR1Q16570 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACKR1Q16570 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ACKR1Q16570 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACKR1Q16570 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACKR1Q16570 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACKR1Q16570 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACKR1Q16570 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACKR1Q16570 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACKR1Q16570 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACKR1Q16570 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACKR1Q16570 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACKR1Q16570 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACKR1Q16570 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACKR1Q16570 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACKR1Q16570 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACKR1Q16570 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACKR1Q16570 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACKR1Q16570 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACKR1Q16570 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ACKR1Q16570 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACKR1Q16570 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACKR1Q16570 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACKR1Q16570 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACKR1Q16570 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACKR1Q16570 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACKR1Q16570 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACKR1Q16570 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACKR1Q16570 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACKR1Q16570 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACKR1Q16570 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACKR1Q16570 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACKR1Q16570 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACKR1Q16570 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACKR1Q16570 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACKR1Q16570 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACKR1Q16570 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ACKR1Q16570 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACKR1Q16570 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACKR1Q16570 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACKR1Q16570 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACKR1Q16570 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACKR1Q16570 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACKR1Q16570 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ACKR1Q16570 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
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