Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABRA6Q16445 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABRA6Q16445 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABRA6Q16445 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GABRA6Q16445 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABRA6Q16445 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABRA6Q16445 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABRA6Q16445 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GABRA6Q16445 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABRA6Q16445 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABRA6Q16445 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABRA6Q16445 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABRA6Q16445 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABRA6Q16445 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABRA6Q16445 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABRA6Q16445 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABRA6Q16445 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABRA6Q16445 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABRA6Q16445 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GABRA6Q16445 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABRA6Q16445 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABRA6Q16445 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABRA6Q16445 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABRA6Q16445 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABRA6Q16445 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABRA6Q16445 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABRA6Q16445 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABRA6Q16445 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABRA6Q16445 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABRA6Q16445 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABRA6Q16445 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABRA6Q16445 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABRA6Q16445 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABRA6Q16445 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABRA6Q16445 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABRA6Q16445 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABRA6Q16445 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABRA6Q16445 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABRA6Q16445 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABRA6Q16445 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABRA6Q16445 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABRA6Q16445 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABRA6Q16445 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABRA6Q16445 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABRA6Q16445 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABRA6Q16445 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABRA6Q16445 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABRA6Q16445 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABRA6Q16445 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABRA6Q16445 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABRA6Q16445 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABRA6Q16445 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GABRA6Q16445 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABRA6Q16445 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABRA6Q16445 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABRA6Q16445 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABRA6Q16445 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABRA6Q16445 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABRA6Q16445 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABRA6Q16445 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABRA6Q16445 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABRA6Q16445 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABRA6Q16445 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABRA6Q16445 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABRA6Q16445 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABRA6Q16445 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABRA6Q16445 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABRA6Q16445 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABRA6Q16445 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GABRA6Q16445 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GABRA6Q16445 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GABRA6Q16445 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GABRA6Q16445 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GABRA6Q16445 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GABRA6Q16445 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GABRA6Q16445 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GABRA6Q16445 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GABRA6Q16445 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GABRA6Q16445 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GABRA6Q16445 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GABRA6Q16445 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GABRA6Q16445 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
GABRA6Q16445 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
GABRA6Q16445 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GABRA6Q16445 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GABRA6Q16445 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
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