Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
VPS72Q15906 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VPS72Q15906 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VPS72Q15906 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
VPS72Q15906 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
VPS72Q15906 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
VPS72Q15906 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
VPS72Q15906 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
VPS72Q15906 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
VPS72Q15906 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
VPS72Q15906 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
VPS72Q15906 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
VPS72Q15906 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
VPS72Q15906 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
VPS72Q15906 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
VPS72Q15906 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
VPS72Q15906 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
VPS72Q15906 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
VPS72Q15906 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
VPS72Q15906 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
VPS72Q15906 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
VPS72Q15906 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
VPS72Q15906 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
VPS72Q15906 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
VPS72Q15906 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
VPS72Q15906 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
VPS72Q15906 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
VPS72Q15906 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
VPS72Q15906 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VPS72Q15906 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VPS72Q15906 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VPS72Q15906 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VPS72Q15906 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VPS72Q15906 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
VPS72Q15906 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VPS72Q15906 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VPS72Q15906 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VPS72Q15906 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
VPS72Q15906 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VPS72Q15906 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
VPS72Q15906 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VPS72Q15906 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VPS72Q15906 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VPS72Q15906 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
VPS72Q15906 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
VPS72Q15906 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VPS72Q15906 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
VPS72Q15906 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VPS72Q15906 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VPS72Q15906 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VPS72Q15906 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VPS72Q15906 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
VPS72Q15906 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
VPS72Q15906 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
VPS72Q15906 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VPS72Q15906 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
VPS72Q15906 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VPS72Q15906 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VPS72Q15906 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
VPS72Q15906 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
VPS72Q15906 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
VPS72Q15906 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
VPS72Q15906 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
VPS72Q15906 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
VPS72Q15906 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
VPS72Q15906 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
VPS72Q15906 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
VPS72Q15906 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
VPS72Q15906 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
VPS72Q15906 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
VPS72Q15906 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
VPS72Q15906 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
VPS72Q15906 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
VPS72Q15906 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
VPS72Q15906 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
VPS72Q15906 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
VPS72Q15906 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
VPS72Q15906 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
VPS72Q15906 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
VPS72Q15906 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
VPS72Q15906 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
VPS72Q15906 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
VPS72Q15906 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
VPS72Q15906 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
VPS72Q15906 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
VPS72Q15906 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
VPS72Q15906 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
VPS72Q15906 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
VPS72Q15906 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
VPS72Q15906 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
VPS72Q15906 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VPS72Q15906 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
VPS72Q15906 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VPS72Q15906 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
VPS72Q15906 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
VPS72Q15906 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VPS72Q15906 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
VPS72Q15906 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
VPS72Q15906 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
VPS72Q15906 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
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