Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP6AP1Q15904 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP6AP1Q15904 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP6AP1Q15904 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP6AP1Q15904 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP6AP1Q15904 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP6AP1Q15904 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP6AP1Q15904 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP6AP1Q15904 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP6AP1Q15904 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP6AP1Q15904 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP6AP1Q15904 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP6AP1Q15904 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP6AP1Q15904 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP6AP1Q15904 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP6AP1Q15904 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP6AP1Q15904 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP6AP1Q15904 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP6AP1Q15904 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP6AP1Q15904 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP6AP1Q15904 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP6AP1Q15904 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP6AP1Q15904 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP6AP1Q15904 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP6AP1Q15904 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP6AP1Q15904 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP6AP1Q15904 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP6AP1Q15904 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP6AP1Q15904 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP6AP1Q15904 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP6AP1Q15904 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP6AP1Q15904 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP6AP1Q15904 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP6AP1Q15904 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP6AP1Q15904 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP6AP1Q15904 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP6AP1Q15904 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP6AP1Q15904 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP6AP1Q15904 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP6AP1Q15904 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP6AP1Q15904 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP6AP1Q15904 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP6AP1Q15904 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP6AP1Q15904 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP6AP1Q15904 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP6AP1Q15904 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP6AP1Q15904 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP6AP1Q15904 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP6AP1Q15904 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP6AP1Q15904 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP6AP1Q15904 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP6AP1Q15904 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP6AP1Q15904 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP6AP1Q15904 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP6AP1Q15904 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP6AP1Q15904 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP6AP1Q15904 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP6AP1Q15904 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP6AP1Q15904 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP6AP1Q15904 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP6AP1Q15904 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP6AP1Q15904 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP6AP1Q15904 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP6AP1Q15904 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP6AP1Q15904 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP6AP1Q15904 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP6AP1Q15904 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP6AP1Q15904 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP6AP1Q15904 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP6AP1Q15904 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP6AP1Q15904 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP6AP1Q15904 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP6AP1Q15904 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP6AP1Q15904 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP6AP1Q15904 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP6AP1Q15904 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP6AP1Q15904 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP6AP1Q15904 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP6AP1Q15904 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP6AP1Q15904 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP6AP1Q15904 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP6AP1Q15904 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP6AP1Q15904 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP6AP1Q15904 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP6AP1Q15904 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP6AP1Q15904 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP6AP1Q15904 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP6AP1Q15904 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP6AP1Q15904 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP6AP1Q15904 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP6AP1Q15904 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP6AP1Q15904 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP6AP1Q15904 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP6AP1Q15904 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP6AP1Q15904 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP6AP1Q15904 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP6AP1Q15904 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP6AP1Q15904 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP6AP1Q15904 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP6AP1Q15904 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
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