Protein–RNA interactions for Protein: Q15637

SF1, Splicing factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF1Q15637 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SF1Q15637 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SF1Q15637 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SF1Q15637 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SF1Q15637 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SF1Q15637 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SF1Q15637 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SF1Q15637 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SF1Q15637 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SF1Q15637 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SF1Q15637 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SF1Q15637 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SF1Q15637 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SF1Q15637 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SF1Q15637 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SF1Q15637 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SF1Q15637 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SF1Q15637 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SF1Q15637 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SF1Q15637 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SF1Q15637 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SF1Q15637 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SF1Q15637 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SF1Q15637 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SF1Q15637 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SF1Q15637 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SF1Q15637 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SF1Q15637 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SF1Q15637 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SF1Q15637 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SF1Q15637 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SF1Q15637 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SF1Q15637 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SF1Q15637 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SF1Q15637 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SF1Q15637 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SF1Q15637 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SF1Q15637 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SF1Q15637 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SF1Q15637 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SF1Q15637 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SF1Q15637 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SF1Q15637 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SF1Q15637 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SF1Q15637 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SF1Q15637 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SF1Q15637 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SF1Q15637 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SF1Q15637 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SF1Q15637 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SF1Q15637 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SF1Q15637 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SF1Q15637 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SF1Q15637 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SF1Q15637 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SF1Q15637 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SF1Q15637 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SF1Q15637 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SF1Q15637 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SF1Q15637 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SF1Q15637 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SF1Q15637 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SF1Q15637 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SF1Q15637 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SF1Q15637 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SF1Q15637 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SF1Q15637 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SF1Q15637 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SF1Q15637 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SF1Q15637 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SF1Q15637 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SF1Q15637 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SF1Q15637 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SF1Q15637 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SF1Q15637 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SF1Q15637 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SF1Q15637 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SF1Q15637 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SF1Q15637 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SF1Q15637 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SF1Q15637 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SF1Q15637 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SF1Q15637 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SF1Q15637 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SF1Q15637 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SF1Q15637 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SF1Q15637 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SF1Q15637 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SF1Q15637 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SF1Q15637 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SF1Q15637 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SF1Q15637 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SF1Q15637 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SF1Q15637 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SF1Q15637 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SF1Q15637 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SF1Q15637 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SF1Q15637 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SF1Q15637 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SF1Q15637 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms