Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDCD1Q15116 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
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