Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
R3HDM1Q15032 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
R3HDM1Q15032 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
R3HDM1Q15032 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
R3HDM1Q15032 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
R3HDM1Q15032 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
R3HDM1Q15032 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
R3HDM1Q15032 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
R3HDM1Q15032 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
R3HDM1Q15032 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
R3HDM1Q15032 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
R3HDM1Q15032 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
R3HDM1Q15032 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
R3HDM1Q15032 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
R3HDM1Q15032 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
R3HDM1Q15032 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
R3HDM1Q15032 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
R3HDM1Q15032 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
R3HDM1Q15032 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
R3HDM1Q15032 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
R3HDM1Q15032 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
R3HDM1Q15032 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
R3HDM1Q15032 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
R3HDM1Q15032 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
R3HDM1Q15032 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
R3HDM1Q15032 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
R3HDM1Q15032 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
R3HDM1Q15032 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
R3HDM1Q15032 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
R3HDM1Q15032 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
R3HDM1Q15032 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
R3HDM1Q15032 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
R3HDM1Q15032 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
R3HDM1Q15032 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
R3HDM1Q15032 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
R3HDM1Q15032 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
R3HDM1Q15032 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
R3HDM1Q15032 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
R3HDM1Q15032 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
R3HDM1Q15032 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
R3HDM1Q15032 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
R3HDM1Q15032 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
R3HDM1Q15032 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
R3HDM1Q15032 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
R3HDM1Q15032 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
R3HDM1Q15032 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
R3HDM1Q15032 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
R3HDM1Q15032 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
R3HDM1Q15032 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
R3HDM1Q15032 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
R3HDM1Q15032 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
R3HDM1Q15032 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
R3HDM1Q15032 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
R3HDM1Q15032 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
R3HDM1Q15032 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
R3HDM1Q15032 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
R3HDM1Q15032 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
R3HDM1Q15032 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
R3HDM1Q15032 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
R3HDM1Q15032 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
R3HDM1Q15032 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
R3HDM1Q15032 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
R3HDM1Q15032 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
R3HDM1Q15032 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
R3HDM1Q15032 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
R3HDM1Q15032 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
R3HDM1Q15032 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
R3HDM1Q15032 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
R3HDM1Q15032 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
R3HDM1Q15032 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
R3HDM1Q15032 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
R3HDM1Q15032 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
R3HDM1Q15032 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
R3HDM1Q15032 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
R3HDM1Q15032 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
R3HDM1Q15032 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
R3HDM1Q15032 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
R3HDM1Q15032 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
R3HDM1Q15032 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
R3HDM1Q15032 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
R3HDM1Q15032 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
R3HDM1Q15032 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
R3HDM1Q15032 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
R3HDM1Q15032 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
R3HDM1Q15032 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
R3HDM1Q15032 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
R3HDM1Q15032 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
R3HDM1Q15032 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
R3HDM1Q15032 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
R3HDM1Q15032 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
R3HDM1Q15032 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
R3HDM1Q15032 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
R3HDM1Q15032 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
R3HDM1Q15032 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
R3HDM1Q15032 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
R3HDM1Q15032 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
R3HDM1Q15032 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
R3HDM1Q15032 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
R3HDM1Q15032 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
R3HDM1Q15032 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
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