Protein–RNA interactions for Protein: Q14515

SPARCL1, SPARC-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPARCL1Q14515 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPARCL1Q14515 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPARCL1Q14515 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SPARCL1Q14515 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPARCL1Q14515 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPARCL1Q14515 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPARCL1Q14515 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPARCL1Q14515 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPARCL1Q14515 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPARCL1Q14515 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPARCL1Q14515 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPARCL1Q14515 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPARCL1Q14515 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPARCL1Q14515 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPARCL1Q14515 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPARCL1Q14515 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPARCL1Q14515 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPARCL1Q14515 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPARCL1Q14515 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPARCL1Q14515 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPARCL1Q14515 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SPARCL1Q14515 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPARCL1Q14515 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPARCL1Q14515 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPARCL1Q14515 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPARCL1Q14515 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPARCL1Q14515 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPARCL1Q14515 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPARCL1Q14515 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPARCL1Q14515 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPARCL1Q14515 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPARCL1Q14515 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPARCL1Q14515 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPARCL1Q14515 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SPARCL1Q14515 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPARCL1Q14515 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SPARCL1Q14515 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPARCL1Q14515 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPARCL1Q14515 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPARCL1Q14515 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPARCL1Q14515 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPARCL1Q14515 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPARCL1Q14515 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPARCL1Q14515 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPARCL1Q14515 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPARCL1Q14515 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPARCL1Q14515 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPARCL1Q14515 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPARCL1Q14515 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPARCL1Q14515 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPARCL1Q14515 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPARCL1Q14515 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPARCL1Q14515 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPARCL1Q14515 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SPARCL1Q14515 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPARCL1Q14515 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SPARCL1Q14515 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPARCL1Q14515 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPARCL1Q14515 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SPARCL1Q14515 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPARCL1Q14515 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPARCL1Q14515 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPARCL1Q14515 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPARCL1Q14515 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPARCL1Q14515 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPARCL1Q14515 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPARCL1Q14515 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPARCL1Q14515 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPARCL1Q14515 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPARCL1Q14515 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPARCL1Q14515 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPARCL1Q14515 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPARCL1Q14515 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPARCL1Q14515 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPARCL1Q14515 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPARCL1Q14515 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPARCL1Q14515 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPARCL1Q14515 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPARCL1Q14515 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPARCL1Q14515 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPARCL1Q14515 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPARCL1Q14515 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPARCL1Q14515 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPARCL1Q14515 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPARCL1Q14515 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SPARCL1Q14515 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPARCL1Q14515 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPARCL1Q14515 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPARCL1Q14515 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPARCL1Q14515 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPARCL1Q14515 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPARCL1Q14515 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPARCL1Q14515 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPARCL1Q14515 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPARCL1Q14515 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPARCL1Q14515 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPARCL1Q14515 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPARCL1Q14515 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SPARCL1Q14515 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPARCL1Q14515 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
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