Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
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PDE6HQ13956 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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PDE6HQ13956 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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PDE6HQ13956 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
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PDE6HQ13956 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PDE6HQ13956 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PDE6HQ13956 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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PDE6HQ13956 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PDE6HQ13956 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PDE6HQ13956 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PDE6HQ13956 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PDE6HQ13956 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PDE6HQ13956 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PDE6HQ13956 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PDE6HQ13956 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PDE6HQ13956 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PDE6HQ13956 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PDE6HQ13956 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PDE6HQ13956 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PDE6HQ13956 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PDE6HQ13956 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PDE6HQ13956 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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