Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPTAN1Q13813 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPTAN1Q13813 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPTAN1Q13813 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPTAN1Q13813 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPTAN1Q13813 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPTAN1Q13813 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPTAN1Q13813 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPTAN1Q13813 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPTAN1Q13813 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPTAN1Q13813 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPTAN1Q13813 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPTAN1Q13813 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPTAN1Q13813 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPTAN1Q13813 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SPTAN1Q13813 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SPTAN1Q13813 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPTAN1Q13813 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPTAN1Q13813 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPTAN1Q13813 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPTAN1Q13813 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPTAN1Q13813 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPTAN1Q13813 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPTAN1Q13813 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPTAN1Q13813 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPTAN1Q13813 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPTAN1Q13813 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPTAN1Q13813 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPTAN1Q13813 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPTAN1Q13813 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPTAN1Q13813 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPTAN1Q13813 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPTAN1Q13813 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPTAN1Q13813 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPTAN1Q13813 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPTAN1Q13813 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPTAN1Q13813 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPTAN1Q13813 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPTAN1Q13813 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPTAN1Q13813 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SPTAN1Q13813 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPTAN1Q13813 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPTAN1Q13813 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPTAN1Q13813 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPTAN1Q13813 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPTAN1Q13813 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPTAN1Q13813 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPTAN1Q13813 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPTAN1Q13813 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPTAN1Q13813 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPTAN1Q13813 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPTAN1Q13813 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPTAN1Q13813 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPTAN1Q13813 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPTAN1Q13813 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPTAN1Q13813 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPTAN1Q13813 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPTAN1Q13813 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SPTAN1Q13813 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPTAN1Q13813 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPTAN1Q13813 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPTAN1Q13813 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPTAN1Q13813 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPTAN1Q13813 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPTAN1Q13813 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPTAN1Q13813 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SPTAN1Q13813 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPTAN1Q13813 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPTAN1Q13813 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPTAN1Q13813 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPTAN1Q13813 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPTAN1Q13813 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPTAN1Q13813 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPTAN1Q13813 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPTAN1Q13813 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPTAN1Q13813 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPTAN1Q13813 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPTAN1Q13813 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPTAN1Q13813 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPTAN1Q13813 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPTAN1Q13813 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SPTAN1Q13813 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPTAN1Q13813 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.34
SPTAN1Q13813 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
SPTAN1Q13813 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
SPTAN1Q13813 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPTAN1Q13813 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPTAN1Q13813 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPTAN1Q13813 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPTAN1Q13813 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPTAN1Q13813 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPTAN1Q13813 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPTAN1Q13813 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPTAN1Q13813 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPTAN1Q13813 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPTAN1Q13813 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPTAN1Q13813 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPTAN1Q13813 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPTAN1Q13813 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPTAN1Q13813 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
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