Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
APOFQ13790 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOFQ13790 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOFQ13790 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOFQ13790 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOFQ13790 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOFQ13790 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOFQ13790 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOFQ13790 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOFQ13790 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOFQ13790 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOFQ13790 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOFQ13790 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOFQ13790 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOFQ13790 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOFQ13790 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOFQ13790 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOFQ13790 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOFQ13790 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOFQ13790 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOFQ13790 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOFQ13790 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOFQ13790 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOFQ13790 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOFQ13790 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
APOFQ13790 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
APOFQ13790 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOFQ13790 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOFQ13790 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
APOFQ13790 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOFQ13790 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOFQ13790 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOFQ13790 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOFQ13790 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOFQ13790 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOFQ13790 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOFQ13790 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOFQ13790 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOFQ13790 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOFQ13790 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOFQ13790 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOFQ13790 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOFQ13790 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOFQ13790 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOFQ13790 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOFQ13790 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOFQ13790 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
APOFQ13790 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOFQ13790 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOFQ13790 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
APOFQ13790 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOFQ13790 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOFQ13790 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
APOFQ13790 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
APOFQ13790 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
APOFQ13790 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
APOFQ13790 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
APOFQ13790 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
APOFQ13790 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOFQ13790 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOFQ13790 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOFQ13790 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOFQ13790 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOFQ13790 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOFQ13790 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOFQ13790 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOFQ13790 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
APOFQ13790 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
APOFQ13790 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
APOFQ13790 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
APOFQ13790 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
APOFQ13790 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
APOFQ13790 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOFQ13790 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOFQ13790 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOFQ13790 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOFQ13790 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOFQ13790 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOFQ13790 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOFQ13790 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOFQ13790 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOFQ13790 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOFQ13790 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOFQ13790 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOFQ13790 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
APOFQ13790 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOFQ13790 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOFQ13790 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOFQ13790 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOFQ13790 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOFQ13790 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOFQ13790 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOFQ13790 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOFQ13790 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOFQ13790 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOFQ13790 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOFQ13790 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOFQ13790 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOFQ13790 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOFQ13790 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
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