Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

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Length 498 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IRF5Q13568 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IRF5Q13568 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IRF5Q13568 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IRF5Q13568 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IRF5Q13568 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IRF5Q13568 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IRF5Q13568 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IRF5Q13568 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IRF5Q13568 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IRF5Q13568 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IRF5Q13568 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IRF5Q13568 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IRF5Q13568 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
IRF5Q13568 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IRF5Q13568 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IRF5Q13568 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IRF5Q13568 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
IRF5Q13568 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IRF5Q13568 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IRF5Q13568 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IRF5Q13568 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IRF5Q13568 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
IRF5Q13568 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
IRF5Q13568 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
IRF5Q13568 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
IRF5Q13568 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
IRF5Q13568 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IRF5Q13568 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IRF5Q13568 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IRF5Q13568 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IRF5Q13568 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IRF5Q13568 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IRF5Q13568 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IRF5Q13568 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IRF5Q13568 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IRF5Q13568 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IRF5Q13568 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IRF5Q13568 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IRF5Q13568 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IRF5Q13568 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IRF5Q13568 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IRF5Q13568 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IRF5Q13568 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IRF5Q13568 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IRF5Q13568 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IRF5Q13568 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IRF5Q13568 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IRF5Q13568 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRF5Q13568 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRF5Q13568 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRF5Q13568 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRF5Q13568 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRF5Q13568 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRF5Q13568 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRF5Q13568 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRF5Q13568 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRF5Q13568 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRF5Q13568 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRF5Q13568 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRF5Q13568 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRF5Q13568 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRF5Q13568 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRF5Q13568 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRF5Q13568 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRF5Q13568 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRF5Q13568 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRF5Q13568 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRF5Q13568 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRF5Q13568 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRF5Q13568 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
IRF5Q13568 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRF5Q13568 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRF5Q13568 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRF5Q13568 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRF5Q13568 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRF5Q13568 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRF5Q13568 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRF5Q13568 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRF5Q13568 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IRF5Q13568 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IRF5Q13568 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IRF5Q13568 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IRF5Q13568 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IRF5Q13568 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IRF5Q13568 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IRF5Q13568 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IRF5Q13568 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IRF5Q13568 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IRF5Q13568 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IRF5Q13568 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IRF5Q13568 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IRF5Q13568 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IRF5Q13568 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
IRF5Q13568 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IRF5Q13568 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IRF5Q13568 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IRF5Q13568 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IRF5Q13568 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IRF5Q13568 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
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