Protein–RNA interactions for Protein: Q13491

GPM6B, Neuronal membrane glycoprotein M6-b, humanhuman

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Length 265 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPM6BQ13491 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GPM6BQ13491 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GPM6BQ13491 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GPM6BQ13491 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GPM6BQ13491 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GPM6BQ13491 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GPM6BQ13491 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GPM6BQ13491 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GPM6BQ13491 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GPM6BQ13491 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GPM6BQ13491 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GPM6BQ13491 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GPM6BQ13491 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GPM6BQ13491 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GPM6BQ13491 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GPM6BQ13491 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GPM6BQ13491 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GPM6BQ13491 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GPM6BQ13491 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GPM6BQ13491 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GPM6BQ13491 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GPM6BQ13491 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GPM6BQ13491 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GPM6BQ13491 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GPM6BQ13491 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GPM6BQ13491 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GPM6BQ13491 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GPM6BQ13491 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
GPM6BQ13491 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GPM6BQ13491 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GPM6BQ13491 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GPM6BQ13491 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
GPM6BQ13491 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GPM6BQ13491 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GPM6BQ13491 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GPM6BQ13491 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GPM6BQ13491 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
GPM6BQ13491 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GPM6BQ13491 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GPM6BQ13491 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GPM6BQ13491 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GPM6BQ13491 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GPM6BQ13491 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GPM6BQ13491 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GPM6BQ13491 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GPM6BQ13491 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GPM6BQ13491 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GPM6BQ13491 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GPM6BQ13491 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GPM6BQ13491 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
GPM6BQ13491 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GPM6BQ13491 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GPM6BQ13491 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GPM6BQ13491 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GPM6BQ13491 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
GPM6BQ13491 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GPM6BQ13491 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GPM6BQ13491 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GPM6BQ13491 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GPM6BQ13491 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GPM6BQ13491 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GPM6BQ13491 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GPM6BQ13491 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GPM6BQ13491 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GPM6BQ13491 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GPM6BQ13491 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GPM6BQ13491 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GPM6BQ13491 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GPM6BQ13491 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GPM6BQ13491 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GPM6BQ13491 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GPM6BQ13491 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GPM6BQ13491 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GPM6BQ13491 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GPM6BQ13491 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GPM6BQ13491 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GPM6BQ13491 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GPM6BQ13491 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GPM6BQ13491 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GPM6BQ13491 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GPM6BQ13491 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GPM6BQ13491 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GPM6BQ13491 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GPM6BQ13491 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GPM6BQ13491 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GPM6BQ13491 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GPM6BQ13491 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GPM6BQ13491 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GPM6BQ13491 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
GPM6BQ13491 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GPM6BQ13491 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GPM6BQ13491 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GPM6BQ13491 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GPM6BQ13491 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
GPM6BQ13491 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GPM6BQ13491 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GPM6BQ13491 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GPM6BQ13491 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GPM6BQ13491 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GPM6BQ13491 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
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