Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMAD4Q13485 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMAD4Q13485 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMAD4Q13485 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMAD4Q13485 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMAD4Q13485 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMAD4Q13485 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMAD4Q13485 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMAD4Q13485 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMAD4Q13485 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMAD4Q13485 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMAD4Q13485 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMAD4Q13485 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMAD4Q13485 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMAD4Q13485 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SMAD4Q13485 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SMAD4Q13485 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMAD4Q13485 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMAD4Q13485 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMAD4Q13485 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SMAD4Q13485 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMAD4Q13485 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMAD4Q13485 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SMAD4Q13485 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMAD4Q13485 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMAD4Q13485 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMAD4Q13485 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SMAD4Q13485 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMAD4Q13485 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMAD4Q13485 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMAD4Q13485 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMAD4Q13485 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMAD4Q13485 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMAD4Q13485 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMAD4Q13485 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMAD4Q13485 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMAD4Q13485 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMAD4Q13485 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMAD4Q13485 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMAD4Q13485 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMAD4Q13485 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMAD4Q13485 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMAD4Q13485 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SMAD4Q13485 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMAD4Q13485 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMAD4Q13485 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMAD4Q13485 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMAD4Q13485 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMAD4Q13485 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMAD4Q13485 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMAD4Q13485 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMAD4Q13485 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMAD4Q13485 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMAD4Q13485 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMAD4Q13485 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMAD4Q13485 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMAD4Q13485 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMAD4Q13485 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMAD4Q13485 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMAD4Q13485 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMAD4Q13485 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMAD4Q13485 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SMAD4Q13485 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMAD4Q13485 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMAD4Q13485 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMAD4Q13485 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMAD4Q13485 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMAD4Q13485 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMAD4Q13485 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMAD4Q13485 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMAD4Q13485 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMAD4Q13485 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMAD4Q13485 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMAD4Q13485 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SMAD4Q13485 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMAD4Q13485 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMAD4Q13485 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMAD4Q13485 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMAD4Q13485 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMAD4Q13485 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMAD4Q13485 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMAD4Q13485 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMAD4Q13485 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMAD4Q13485 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMAD4Q13485 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMAD4Q13485 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMAD4Q13485 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMAD4Q13485 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMAD4Q13485 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMAD4Q13485 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMAD4Q13485 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMAD4Q13485 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMAD4Q13485 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMAD4Q13485 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SMAD4Q13485 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMAD4Q13485 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMAD4Q13485 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMAD4Q13485 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMAD4Q13485 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMAD4Q13485 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
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