Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LSAMPQ13449 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LSAMPQ13449 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
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