Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
MKRN4PQ13434 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
MKRN4PQ13434 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MKRN4PQ13434 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MKRN4PQ13434 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MKRN4PQ13434 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MKRN4PQ13434 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MKRN4PQ13434 LINC00972-202ENST00000438065 788 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MKRN4PQ13434 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MKRN4PQ13434 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
MKRN4PQ13434 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MKRN4PQ13434 AC010181.2-201ENST00000483759 482 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MKRN4PQ13434 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MKRN4PQ13434 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MKRN4PQ13434 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MKRN4PQ13434 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MKRN4PQ13434 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MKRN4PQ13434 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MKRN4PQ13434 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MKRN4PQ13434 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MKRN4PQ13434 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
MKRN4PQ13434 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
MKRN4PQ13434 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
MKRN4PQ13434 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MKRN4PQ13434 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
MKRN4PQ13434 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MKRN4PQ13434 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MKRN4PQ13434 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
MKRN4PQ13434 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
MKRN4PQ13434 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MKRN4PQ13434 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MKRN4PQ13434 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MKRN4PQ13434 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
MKRN4PQ13434 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MKRN4PQ13434 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MKRN4PQ13434 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MKRN4PQ13434 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MKRN4PQ13434 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MKRN4PQ13434 AC106744.2-201ENST00000513955 898 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MKRN4PQ13434 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MKRN4PQ13434 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MKRN4PQ13434 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
MKRN4PQ13434 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MKRN4PQ13434 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MKRN4PQ13434 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MKRN4PQ13434 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MKRN4PQ13434 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MKRN4PQ13434 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MKRN4PQ13434 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MKRN4PQ13434 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MKRN4PQ13434 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MKRN4PQ13434 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MKRN4PQ13434 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MKRN4PQ13434 AL035696.2-201ENST00000407941 709 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
MKRN4PQ13434 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
MKRN4PQ13434 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MKRN4PQ13434 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
MKRN4PQ13434 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MKRN4PQ13434 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MKRN4PQ13434 AC124312.2-201ENST00000546615 427 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MKRN4PQ13434 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MKRN4PQ13434 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MKRN4PQ13434 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MKRN4PQ13434 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MKRN4PQ13434 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MKRN4PQ13434 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MKRN4PQ13434 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MKRN4PQ13434 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MKRN4PQ13434 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MKRN4PQ13434 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MKRN4PQ13434 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MKRN4PQ13434 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MKRN4PQ13434 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MKRN4PQ13434 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MKRN4PQ13434 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MKRN4PQ13434 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MKRN4PQ13434 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MKRN4PQ13434 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MKRN4PQ13434 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MKRN4PQ13434 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MKRN4PQ13434 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
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MKRN4PQ13434 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MKRN4PQ13434 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MKRN4PQ13434 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
MKRN4PQ13434 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MKRN4PQ13434 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MKRN4PQ13434 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MKRN4PQ13434 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MKRN4PQ13434 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
MKRN4PQ13434 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MKRN4PQ13434 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MKRN4PQ13434 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MKRN4PQ13434 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MKRN4PQ13434 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MKRN4PQ13434 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MKRN4PQ13434 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MKRN4PQ13434 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MKRN4PQ13434 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MKRN4PQ13434 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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