Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
XRCC4Q13426 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
XRCC4Q13426 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
XRCC4Q13426 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
XRCC4Q13426 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
XRCC4Q13426 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
XRCC4Q13426 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
XRCC4Q13426 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
XRCC4Q13426 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
XRCC4Q13426 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
XRCC4Q13426 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
XRCC4Q13426 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
XRCC4Q13426 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
XRCC4Q13426 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
XRCC4Q13426 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
XRCC4Q13426 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
XRCC4Q13426 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
XRCC4Q13426 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
XRCC4Q13426 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
XRCC4Q13426 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
XRCC4Q13426 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
XRCC4Q13426 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
XRCC4Q13426 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
XRCC4Q13426 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
XRCC4Q13426 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
XRCC4Q13426 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
XRCC4Q13426 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
XRCC4Q13426 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
XRCC4Q13426 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
XRCC4Q13426 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
XRCC4Q13426 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
XRCC4Q13426 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
XRCC4Q13426 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
XRCC4Q13426 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
XRCC4Q13426 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
XRCC4Q13426 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
XRCC4Q13426 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
XRCC4Q13426 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
XRCC4Q13426 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
XRCC4Q13426 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
XRCC4Q13426 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
XRCC4Q13426 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
XRCC4Q13426 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
XRCC4Q13426 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
XRCC4Q13426 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
XRCC4Q13426 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
XRCC4Q13426 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
XRCC4Q13426 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
XRCC4Q13426 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
XRCC4Q13426 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
XRCC4Q13426 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
XRCC4Q13426 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
XRCC4Q13426 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
XRCC4Q13426 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
XRCC4Q13426 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
XRCC4Q13426 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
XRCC4Q13426 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
XRCC4Q13426 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
XRCC4Q13426 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
XRCC4Q13426 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
XRCC4Q13426 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
XRCC4Q13426 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
XRCC4Q13426 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
XRCC4Q13426 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
XRCC4Q13426 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
XRCC4Q13426 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
XRCC4Q13426 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
XRCC4Q13426 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
XRCC4Q13426 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
XRCC4Q13426 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
XRCC4Q13426 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
XRCC4Q13426 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
XRCC4Q13426 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
XRCC4Q13426 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
XRCC4Q13426 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
XRCC4Q13426 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
XRCC4Q13426 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
XRCC4Q13426 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
XRCC4Q13426 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
XRCC4Q13426 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
XRCC4Q13426 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
XRCC4Q13426 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
XRCC4Q13426 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
XRCC4Q13426 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
XRCC4Q13426 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
XRCC4Q13426 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
XRCC4Q13426 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
XRCC4Q13426 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
XRCC4Q13426 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
XRCC4Q13426 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
XRCC4Q13426 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
XRCC4Q13426 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
XRCC4Q13426 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
XRCC4Q13426 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
XRCC4Q13426 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
XRCC4Q13426 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
XRCC4Q13426 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
XRCC4Q13426 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
XRCC4Q13426 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
XRCC4Q13426 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
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