Protein–RNA interactions for Protein: Q13424

SNTA1, Alpha-1-syntrophin, humanhuman

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Length 505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTA1Q13424 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SNTA1Q13424 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNTA1Q13424 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SNTA1Q13424 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNTA1Q13424 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNTA1Q13424 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNTA1Q13424 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNTA1Q13424 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNTA1Q13424 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNTA1Q13424 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNTA1Q13424 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNTA1Q13424 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNTA1Q13424 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNTA1Q13424 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNTA1Q13424 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNTA1Q13424 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNTA1Q13424 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNTA1Q13424 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNTA1Q13424 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNTA1Q13424 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNTA1Q13424 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SNTA1Q13424 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNTA1Q13424 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNTA1Q13424 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNTA1Q13424 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNTA1Q13424 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNTA1Q13424 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNTA1Q13424 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNTA1Q13424 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SNTA1Q13424 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNTA1Q13424 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNTA1Q13424 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNTA1Q13424 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNTA1Q13424 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNTA1Q13424 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNTA1Q13424 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNTA1Q13424 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNTA1Q13424 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNTA1Q13424 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNTA1Q13424 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNTA1Q13424 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNTA1Q13424 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNTA1Q13424 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNTA1Q13424 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNTA1Q13424 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SNTA1Q13424 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNTA1Q13424 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNTA1Q13424 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNTA1Q13424 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNTA1Q13424 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SNTA1Q13424 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNTA1Q13424 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNTA1Q13424 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNTA1Q13424 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNTA1Q13424 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SNTA1Q13424 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNTA1Q13424 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNTA1Q13424 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SNTA1Q13424 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNTA1Q13424 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNTA1Q13424 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNTA1Q13424 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNTA1Q13424 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNTA1Q13424 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNTA1Q13424 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNTA1Q13424 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNTA1Q13424 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNTA1Q13424 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNTA1Q13424 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNTA1Q13424 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNTA1Q13424 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SNTA1Q13424 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNTA1Q13424 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNTA1Q13424 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SNTA1Q13424 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNTA1Q13424 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNTA1Q13424 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNTA1Q13424 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNTA1Q13424 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
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