Protein–RNA interactions for Protein: Q13206

DDX10, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX10Q13206 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
DDX10Q13206 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
DDX10Q13206 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
DDX10Q13206 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
DDX10Q13206 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
DDX10Q13206 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
DDX10Q13206 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
DDX10Q13206 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
DDX10Q13206 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
DDX10Q13206 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
DDX10Q13206 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
DDX10Q13206 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
DDX10Q13206 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
DDX10Q13206 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
DDX10Q13206 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
DDX10Q13206 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
DDX10Q13206 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
DDX10Q13206 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
DDX10Q13206 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
DDX10Q13206 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
DDX10Q13206 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
DDX10Q13206 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
DDX10Q13206 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
DDX10Q13206 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
DDX10Q13206 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
DDX10Q13206 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
DDX10Q13206 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
DDX10Q13206 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
DDX10Q13206 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
DDX10Q13206 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
DDX10Q13206 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
DDX10Q13206 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
DDX10Q13206 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
DDX10Q13206 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
DDX10Q13206 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
DDX10Q13206 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
DDX10Q13206 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
DDX10Q13206 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
DDX10Q13206 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
DDX10Q13206 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
DDX10Q13206 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
DDX10Q13206 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
DDX10Q13206 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
DDX10Q13206 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
DDX10Q13206 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
DDX10Q13206 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
DDX10Q13206 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
DDX10Q13206 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
DDX10Q13206 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
DDX10Q13206 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
DDX10Q13206 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
DDX10Q13206 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
DDX10Q13206 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
DDX10Q13206 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
DDX10Q13206 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
DDX10Q13206 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
DDX10Q13206 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
DDX10Q13206 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
DDX10Q13206 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
DDX10Q13206 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
DDX10Q13206 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
DDX10Q13206 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
DDX10Q13206 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
DDX10Q13206 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
DDX10Q13206 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
DDX10Q13206 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
DDX10Q13206 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
DDX10Q13206 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
DDX10Q13206 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
DDX10Q13206 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
DDX10Q13206 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
DDX10Q13206 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
DDX10Q13206 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
DDX10Q13206 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
DDX10Q13206 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
DDX10Q13206 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
DDX10Q13206 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
DDX10Q13206 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
DDX10Q13206 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
DDX10Q13206 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
DDX10Q13206 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
DDX10Q13206 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
DDX10Q13206 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
DDX10Q13206 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
DDX10Q13206 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
DDX10Q13206 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
DDX10Q13206 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
DDX10Q13206 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
DDX10Q13206 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
DDX10Q13206 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
DDX10Q13206 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
DDX10Q13206 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
DDX10Q13206 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
DDX10Q13206 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
DDX10Q13206 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
DDX10Q13206 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
DDX10Q13206 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
DDX10Q13206 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
DDX10Q13206 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
DDX10Q13206 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms