Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPA4Q13156 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPA4Q13156 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPA4Q13156 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
RPA4Q13156 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPA4Q13156 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPA4Q13156 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPA4Q13156 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
RPA4Q13156 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPA4Q13156 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPA4Q13156 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPA4Q13156 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
RPA4Q13156 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPA4Q13156 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPA4Q13156 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPA4Q13156 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
RPA4Q13156 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPA4Q13156 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPA4Q13156 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPA4Q13156 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPA4Q13156 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPA4Q13156 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPA4Q13156 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPA4Q13156 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPA4Q13156 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPA4Q13156 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPA4Q13156 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPA4Q13156 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPA4Q13156 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPA4Q13156 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPA4Q13156 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPA4Q13156 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPA4Q13156 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPA4Q13156 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPA4Q13156 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPA4Q13156 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPA4Q13156 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPA4Q13156 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPA4Q13156 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPA4Q13156 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPA4Q13156 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPA4Q13156 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPA4Q13156 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPA4Q13156 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPA4Q13156 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPA4Q13156 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPA4Q13156 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPA4Q13156 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPA4Q13156 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPA4Q13156 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPA4Q13156 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPA4Q13156 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPA4Q13156 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPA4Q13156 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPA4Q13156 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPA4Q13156 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPA4Q13156 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPA4Q13156 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPA4Q13156 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPA4Q13156 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPA4Q13156 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPA4Q13156 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPA4Q13156 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPA4Q13156 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPA4Q13156 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPA4Q13156 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPA4Q13156 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPA4Q13156 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPA4Q13156 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPA4Q13156 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPA4Q13156 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPA4Q13156 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPA4Q13156 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPA4Q13156 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPA4Q13156 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPA4Q13156 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPA4Q13156 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPA4Q13156 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPA4Q13156 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPA4Q13156 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
RPA4Q13156 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPA4Q13156 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPA4Q13156 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPA4Q13156 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPA4Q13156 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPA4Q13156 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPA4Q13156 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPA4Q13156 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPA4Q13156 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPA4Q13156 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPA4Q13156 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPA4Q13156 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPA4Q13156 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPA4Q13156 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPA4Q13156 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
RPA4Q13156 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPA4Q13156 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPA4Q13156 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPA4Q13156 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPA4Q13156 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
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