Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC173Q0VFZ6 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC173Q0VFZ6 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC173Q0VFZ6 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC173Q0VFZ6 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC173Q0VFZ6 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC173Q0VFZ6 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC173Q0VFZ6 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC173Q0VFZ6 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC173Q0VFZ6 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC173Q0VFZ6 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC173Q0VFZ6 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC173Q0VFZ6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC173Q0VFZ6 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC173Q0VFZ6 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC173Q0VFZ6 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC173Q0VFZ6 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC173Q0VFZ6 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC173Q0VFZ6 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC173Q0VFZ6 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC173Q0VFZ6 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC173Q0VFZ6 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC173Q0VFZ6 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC173Q0VFZ6 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC173Q0VFZ6 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC173Q0VFZ6 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC173Q0VFZ6 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC173Q0VFZ6 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC173Q0VFZ6 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC173Q0VFZ6 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC173Q0VFZ6 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC173Q0VFZ6 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC173Q0VFZ6 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC173Q0VFZ6 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC173Q0VFZ6 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC173Q0VFZ6 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC173Q0VFZ6 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC173Q0VFZ6 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC173Q0VFZ6 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC173Q0VFZ6 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC173Q0VFZ6 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC173Q0VFZ6 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC173Q0VFZ6 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC173Q0VFZ6 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC173Q0VFZ6 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC173Q0VFZ6 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC173Q0VFZ6 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC173Q0VFZ6 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC173Q0VFZ6 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC173Q0VFZ6 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC173Q0VFZ6 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC173Q0VFZ6 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC173Q0VFZ6 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC173Q0VFZ6 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC173Q0VFZ6 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC173Q0VFZ6 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC173Q0VFZ6 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC173Q0VFZ6 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC173Q0VFZ6 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC173Q0VFZ6 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC173Q0VFZ6 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC173Q0VFZ6 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC173Q0VFZ6 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC173Q0VFZ6 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC173Q0VFZ6 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC173Q0VFZ6 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC173Q0VFZ6 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC173Q0VFZ6 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC173Q0VFZ6 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC173Q0VFZ6 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC173Q0VFZ6 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC173Q0VFZ6 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC173Q0VFZ6 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC173Q0VFZ6 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC173Q0VFZ6 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC173Q0VFZ6 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC173Q0VFZ6 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC173Q0VFZ6 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC173Q0VFZ6 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC173Q0VFZ6 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC173Q0VFZ6 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC173Q0VFZ6 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC173Q0VFZ6 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC173Q0VFZ6 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC173Q0VFZ6 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC173Q0VFZ6 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC173Q0VFZ6 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC173Q0VFZ6 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC173Q0VFZ6 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC173Q0VFZ6 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC173Q0VFZ6 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC173Q0VFZ6 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC173Q0VFZ6 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC173Q0VFZ6 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC173Q0VFZ6 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC173Q0VFZ6 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC173Q0VFZ6 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC173Q0VFZ6 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC173Q0VFZ6 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC173Q0VFZ6 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms