Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NIPAL4Q0D2K0 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NIPAL4Q0D2K0 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NIPAL4Q0D2K0 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
NIPAL4Q0D2K0 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NIPAL4Q0D2K0 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
NIPAL4Q0D2K0 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NIPAL4Q0D2K0 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NIPAL4Q0D2K0 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NIPAL4Q0D2K0 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NIPAL4Q0D2K0 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NIPAL4Q0D2K0 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NIPAL4Q0D2K0 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NIPAL4Q0D2K0 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NIPAL4Q0D2K0 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NIPAL4Q0D2K0 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NIPAL4Q0D2K0 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NIPAL4Q0D2K0 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NIPAL4Q0D2K0 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NIPAL4Q0D2K0 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NIPAL4Q0D2K0 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NIPAL4Q0D2K0 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NIPAL4Q0D2K0 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NIPAL4Q0D2K0 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NIPAL4Q0D2K0 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NIPAL4Q0D2K0 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NIPAL4Q0D2K0 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NIPAL4Q0D2K0 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NIPAL4Q0D2K0 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NIPAL4Q0D2K0 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NIPAL4Q0D2K0 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NIPAL4Q0D2K0 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NIPAL4Q0D2K0 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
NIPAL4Q0D2K0 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
NIPAL4Q0D2K0 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NIPAL4Q0D2K0 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NIPAL4Q0D2K0 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NIPAL4Q0D2K0 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NIPAL4Q0D2K0 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NIPAL4Q0D2K0 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NIPAL4Q0D2K0 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NIPAL4Q0D2K0 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NIPAL4Q0D2K0 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
NIPAL4Q0D2K0 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NIPAL4Q0D2K0 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NIPAL4Q0D2K0 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NIPAL4Q0D2K0 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NIPAL4Q0D2K0 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NIPAL4Q0D2K0 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NIPAL4Q0D2K0 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NIPAL4Q0D2K0 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NIPAL4Q0D2K0 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NIPAL4Q0D2K0 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NIPAL4Q0D2K0 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NIPAL4Q0D2K0 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
NIPAL4Q0D2K0 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NIPAL4Q0D2K0 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NIPAL4Q0D2K0 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NIPAL4Q0D2K0 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NIPAL4Q0D2K0 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NIPAL4Q0D2K0 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NIPAL4Q0D2K0 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NIPAL4Q0D2K0 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NIPAL4Q0D2K0 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NIPAL4Q0D2K0 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NIPAL4Q0D2K0 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NIPAL4Q0D2K0 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NIPAL4Q0D2K0 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NIPAL4Q0D2K0 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NIPAL4Q0D2K0 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NIPAL4Q0D2K0 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NIPAL4Q0D2K0 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
NIPAL4Q0D2K0 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NIPAL4Q0D2K0 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NIPAL4Q0D2K0 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NIPAL4Q0D2K0 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NIPAL4Q0D2K0 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NIPAL4Q0D2K0 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NIPAL4Q0D2K0 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NIPAL4Q0D2K0 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NIPAL4Q0D2K0 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NIPAL4Q0D2K0 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NIPAL4Q0D2K0 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NIPAL4Q0D2K0 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NIPAL4Q0D2K0 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NIPAL4Q0D2K0 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NIPAL4Q0D2K0 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NIPAL4Q0D2K0 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NIPAL4Q0D2K0 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NIPAL4Q0D2K0 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NIPAL4Q0D2K0 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NIPAL4Q0D2K0 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NIPAL4Q0D2K0 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NIPAL4Q0D2K0 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NIPAL4Q0D2K0 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NIPAL4Q0D2K0 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NIPAL4Q0D2K0 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NIPAL4Q0D2K0 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NIPAL4Q0D2K0 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NIPAL4Q0D2K0 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms