Protein–RNA interactions for Protein: Q07889

SOS1, Son of sevenless homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOS1Q07889 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SOS1Q07889 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SOS1Q07889 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SOS1Q07889 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SOS1Q07889 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SOS1Q07889 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SOS1Q07889 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SOS1Q07889 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SOS1Q07889 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SOS1Q07889 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SOS1Q07889 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SOS1Q07889 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SOS1Q07889 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SOS1Q07889 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SOS1Q07889 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SOS1Q07889 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SOS1Q07889 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SOS1Q07889 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SOS1Q07889 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SOS1Q07889 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SOS1Q07889 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SOS1Q07889 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SOS1Q07889 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SOS1Q07889 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SOS1Q07889 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SOS1Q07889 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SOS1Q07889 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SOS1Q07889 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SOS1Q07889 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SOS1Q07889 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SOS1Q07889 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SOS1Q07889 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SOS1Q07889 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SOS1Q07889 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SOS1Q07889 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SOS1Q07889 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SOS1Q07889 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SOS1Q07889 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SOS1Q07889 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SOS1Q07889 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SOS1Q07889 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SOS1Q07889 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SOS1Q07889 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SOS1Q07889 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SOS1Q07889 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SOS1Q07889 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SOS1Q07889 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SOS1Q07889 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SOS1Q07889 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SOS1Q07889 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SOS1Q07889 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SOS1Q07889 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SOS1Q07889 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SOS1Q07889 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SOS1Q07889 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SOS1Q07889 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SOS1Q07889 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SOS1Q07889 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SOS1Q07889 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SOS1Q07889 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SOS1Q07889 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SOS1Q07889 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SOS1Q07889 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SOS1Q07889 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SOS1Q07889 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SOS1Q07889 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SOS1Q07889 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SOS1Q07889 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SOS1Q07889 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SOS1Q07889 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SOS1Q07889 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SOS1Q07889 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SOS1Q07889 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SOS1Q07889 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SOS1Q07889 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SOS1Q07889 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SOS1Q07889 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SOS1Q07889 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SOS1Q07889 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SOS1Q07889 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SOS1Q07889 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SOS1Q07889 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SOS1Q07889 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SOS1Q07889 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SOS1Q07889 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SOS1Q07889 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SOS1Q07889 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SOS1Q07889 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SOS1Q07889 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SOS1Q07889 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SOS1Q07889 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SOS1Q07889 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SOS1Q07889 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SOS1Q07889 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SOS1Q07889 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SOS1Q07889 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SOS1Q07889 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SOS1Q07889 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SOS1Q07889 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SOS1Q07889 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms