Protein–RNA interactions for Protein: Q07343

PDE4B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4BQ07343 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDE4BQ07343 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDE4BQ07343 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDE4BQ07343 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDE4BQ07343 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDE4BQ07343 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDE4BQ07343 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDE4BQ07343 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDE4BQ07343 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDE4BQ07343 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDE4BQ07343 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDE4BQ07343 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDE4BQ07343 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDE4BQ07343 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDE4BQ07343 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDE4BQ07343 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDE4BQ07343 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDE4BQ07343 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDE4BQ07343 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDE4BQ07343 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDE4BQ07343 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDE4BQ07343 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDE4BQ07343 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDE4BQ07343 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDE4BQ07343 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDE4BQ07343 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDE4BQ07343 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDE4BQ07343 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDE4BQ07343 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDE4BQ07343 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDE4BQ07343 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDE4BQ07343 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDE4BQ07343 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDE4BQ07343 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDE4BQ07343 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDE4BQ07343 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDE4BQ07343 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDE4BQ07343 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDE4BQ07343 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDE4BQ07343 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PDE4BQ07343 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PDE4BQ07343 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDE4BQ07343 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDE4BQ07343 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDE4BQ07343 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDE4BQ07343 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDE4BQ07343 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDE4BQ07343 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDE4BQ07343 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDE4BQ07343 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDE4BQ07343 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDE4BQ07343 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDE4BQ07343 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDE4BQ07343 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDE4BQ07343 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDE4BQ07343 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PDE4BQ07343 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDE4BQ07343 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDE4BQ07343 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDE4BQ07343 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDE4BQ07343 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PDE4BQ07343 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDE4BQ07343 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDE4BQ07343 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDE4BQ07343 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDE4BQ07343 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDE4BQ07343 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDE4BQ07343 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDE4BQ07343 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDE4BQ07343 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDE4BQ07343 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDE4BQ07343 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDE4BQ07343 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDE4BQ07343 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDE4BQ07343 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDE4BQ07343 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDE4BQ07343 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDE4BQ07343 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDE4BQ07343 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PDE4BQ07343 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDE4BQ07343 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PDE4BQ07343 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDE4BQ07343 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDE4BQ07343 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDE4BQ07343 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDE4BQ07343 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDE4BQ07343 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDE4BQ07343 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDE4BQ07343 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDE4BQ07343 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PDE4BQ07343 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PDE4BQ07343 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDE4BQ07343 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDE4BQ07343 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDE4BQ07343 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDE4BQ07343 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDE4BQ07343 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PDE4BQ07343 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDE4BQ07343 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDE4BQ07343 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms