Protein–RNA interactions for Protein: Q06455

RUNX1T1, Protein CBFA2T1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX1T1Q06455 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms