Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRKCDQ05655 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PRKCDQ05655 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PRKCDQ05655 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PRKCDQ05655 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PRKCDQ05655 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PRKCDQ05655 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PRKCDQ05655 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRKCDQ05655 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRKCDQ05655 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRKCDQ05655 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRKCDQ05655 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRKCDQ05655 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRKCDQ05655 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRKCDQ05655 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PRKCDQ05655 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRKCDQ05655 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRKCDQ05655 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRKCDQ05655 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRKCDQ05655 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRKCDQ05655 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRKCDQ05655 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRKCDQ05655 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PRKCDQ05655 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRKCDQ05655 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRKCDQ05655 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRKCDQ05655 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRKCDQ05655 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PRKCDQ05655 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRKCDQ05655 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRKCDQ05655 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRKCDQ05655 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRKCDQ05655 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRKCDQ05655 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRKCDQ05655 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRKCDQ05655 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRKCDQ05655 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRKCDQ05655 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRKCDQ05655 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRKCDQ05655 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRKCDQ05655 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRKCDQ05655 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRKCDQ05655 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRKCDQ05655 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PRKCDQ05655 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRKCDQ05655 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PRKCDQ05655 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRKCDQ05655 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PRKCDQ05655 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRKCDQ05655 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRKCDQ05655 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRKCDQ05655 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PRKCDQ05655 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PRKCDQ05655 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRKCDQ05655 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRKCDQ05655 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRKCDQ05655 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRKCDQ05655 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PRKCDQ05655 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PRKCDQ05655 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PRKCDQ05655 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
PRKCDQ05655 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PRKCDQ05655 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PRKCDQ05655 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRKCDQ05655 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRKCDQ05655 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRKCDQ05655 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRKCDQ05655 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRKCDQ05655 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRKCDQ05655 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PRKCDQ05655 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRKCDQ05655 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRKCDQ05655 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRKCDQ05655 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRKCDQ05655 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRKCDQ05655 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRKCDQ05655 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRKCDQ05655 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRKCDQ05655 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRKCDQ05655 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PRKCDQ05655 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRKCDQ05655 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRKCDQ05655 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRKCDQ05655 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRKCDQ05655 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRKCDQ05655 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRKCDQ05655 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRKCDQ05655 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRKCDQ05655 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRKCDQ05655 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRKCDQ05655 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRKCDQ05655 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRKCDQ05655 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRKCDQ05655 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRKCDQ05655 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRKCDQ05655 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRKCDQ05655 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRKCDQ05655 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms