Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPN12Q05209 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPN12Q05209 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPN12Q05209 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPN12Q05209 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPN12Q05209 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPN12Q05209 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPN12Q05209 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPN12Q05209 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPN12Q05209 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPN12Q05209 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPN12Q05209 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPN12Q05209 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPN12Q05209 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPN12Q05209 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPN12Q05209 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPN12Q05209 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPN12Q05209 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPN12Q05209 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPN12Q05209 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPN12Q05209 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPN12Q05209 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPN12Q05209 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPN12Q05209 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPN12Q05209 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PTPN12Q05209 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PTPN12Q05209 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PTPN12Q05209 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPN12Q05209 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPN12Q05209 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPN12Q05209 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPN12Q05209 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPN12Q05209 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPN12Q05209 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPN12Q05209 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPN12Q05209 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPN12Q05209 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPN12Q05209 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPN12Q05209 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPN12Q05209 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPN12Q05209 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPN12Q05209 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPN12Q05209 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPN12Q05209 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPN12Q05209 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPN12Q05209 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPN12Q05209 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPN12Q05209 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPN12Q05209 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPN12Q05209 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPN12Q05209 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPN12Q05209 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPN12Q05209 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPN12Q05209 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPN12Q05209 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPN12Q05209 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPN12Q05209 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPN12Q05209 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPN12Q05209 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPN12Q05209 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPN12Q05209 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPN12Q05209 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPN12Q05209 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPN12Q05209 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPN12Q05209 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPN12Q05209 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPN12Q05209 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPN12Q05209 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPN12Q05209 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPN12Q05209 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPN12Q05209 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPN12Q05209 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPN12Q05209 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPN12Q05209 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPN12Q05209 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPN12Q05209 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPN12Q05209 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPN12Q05209 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPN12Q05209 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPN12Q05209 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPN12Q05209 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPN12Q05209 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPN12Q05209 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPN12Q05209 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPN12Q05209 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPN12Q05209 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPN12Q05209 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPN12Q05209 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPN12Q05209 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPN12Q05209 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPN12Q05209 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPN12Q05209 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPN12Q05209 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPN12Q05209 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPN12Q05209 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPN12Q05209 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPN12Q05209 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPN12Q05209 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPN12Q05209 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPN12Q05209 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms