Protein–RNA interactions for Protein: Q04727

TLE4, Transducin-like enhancer protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLE4Q04727 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TLE4Q04727 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TLE4Q04727 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TLE4Q04727 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TLE4Q04727 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TLE4Q04727 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TLE4Q04727 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TLE4Q04727 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TLE4Q04727 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TLE4Q04727 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TLE4Q04727 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TLE4Q04727 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TLE4Q04727 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TLE4Q04727 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TLE4Q04727 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TLE4Q04727 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TLE4Q04727 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TLE4Q04727 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TLE4Q04727 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TLE4Q04727 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TLE4Q04727 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TLE4Q04727 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TLE4Q04727 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TLE4Q04727 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TLE4Q04727 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TLE4Q04727 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TLE4Q04727 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TLE4Q04727 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TLE4Q04727 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TLE4Q04727 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TLE4Q04727 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TLE4Q04727 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TLE4Q04727 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TLE4Q04727 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TLE4Q04727 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TLE4Q04727 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TLE4Q04727 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TLE4Q04727 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TLE4Q04727 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TLE4Q04727 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TLE4Q04727 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TLE4Q04727 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TLE4Q04727 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TLE4Q04727 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TLE4Q04727 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TLE4Q04727 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TLE4Q04727 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TLE4Q04727 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TLE4Q04727 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TLE4Q04727 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TLE4Q04727 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TLE4Q04727 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TLE4Q04727 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TLE4Q04727 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TLE4Q04727 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TLE4Q04727 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TLE4Q04727 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TLE4Q04727 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TLE4Q04727 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TLE4Q04727 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TLE4Q04727 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TLE4Q04727 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TLE4Q04727 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TLE4Q04727 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TLE4Q04727 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TLE4Q04727 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TLE4Q04727 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TLE4Q04727 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TLE4Q04727 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TLE4Q04727 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TLE4Q04727 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TLE4Q04727 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TLE4Q04727 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TLE4Q04727 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TLE4Q04727 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TLE4Q04727 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TLE4Q04727 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TLE4Q04727 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TLE4Q04727 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TLE4Q04727 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TLE4Q04727 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TLE4Q04727 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TLE4Q04727 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TLE4Q04727 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TLE4Q04727 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TLE4Q04727 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TLE4Q04727 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TLE4Q04727 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TLE4Q04727 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TLE4Q04727 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TLE4Q04727 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TLE4Q04727 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TLE4Q04727 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TLE4Q04727 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TLE4Q04727 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TLE4Q04727 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TLE4Q04727 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TLE4Q04727 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TLE4Q04727 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TLE4Q04727 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms