Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GBE1Q04446 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GBE1Q04446 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GBE1Q04446 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GBE1Q04446 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GBE1Q04446 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GBE1Q04446 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GBE1Q04446 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GBE1Q04446 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GBE1Q04446 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GBE1Q04446 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GBE1Q04446 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GBE1Q04446 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GBE1Q04446 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GBE1Q04446 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GBE1Q04446 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GBE1Q04446 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GBE1Q04446 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GBE1Q04446 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GBE1Q04446 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GBE1Q04446 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GBE1Q04446 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GBE1Q04446 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GBE1Q04446 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GBE1Q04446 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GBE1Q04446 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GBE1Q04446 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GBE1Q04446 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GBE1Q04446 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GBE1Q04446 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GBE1Q04446 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GBE1Q04446 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GBE1Q04446 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GBE1Q04446 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GBE1Q04446 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GBE1Q04446 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GBE1Q04446 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GBE1Q04446 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GBE1Q04446 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GBE1Q04446 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GBE1Q04446 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GBE1Q04446 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GBE1Q04446 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GBE1Q04446 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GBE1Q04446 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GBE1Q04446 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GBE1Q04446 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GBE1Q04446 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GBE1Q04446 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GBE1Q04446 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GBE1Q04446 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GBE1Q04446 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GBE1Q04446 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GBE1Q04446 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GBE1Q04446 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GBE1Q04446 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GBE1Q04446 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GBE1Q04446 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GBE1Q04446 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GBE1Q04446 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GBE1Q04446 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GBE1Q04446 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GBE1Q04446 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GBE1Q04446 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GBE1Q04446 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GBE1Q04446 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GBE1Q04446 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GBE1Q04446 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GBE1Q04446 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GBE1Q04446 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GBE1Q04446 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GBE1Q04446 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GBE1Q04446 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GBE1Q04446 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GBE1Q04446 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GBE1Q04446 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GBE1Q04446 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GBE1Q04446 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GBE1Q04446 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GBE1Q04446 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GBE1Q04446 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GBE1Q04446 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GBE1Q04446 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GBE1Q04446 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GBE1Q04446 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GBE1Q04446 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GBE1Q04446 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GBE1Q04446 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GBE1Q04446 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GBE1Q04446 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GBE1Q04446 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GBE1Q04446 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GBE1Q04446 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GBE1Q04446 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GBE1Q04446 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GBE1Q04446 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GBE1Q04446 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GBE1Q04446 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GBE1Q04446 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GBE1Q04446 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms