Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CENPCQ03188 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CENPCQ03188 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CENPCQ03188 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CENPCQ03188 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CENPCQ03188 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CENPCQ03188 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CENPCQ03188 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CENPCQ03188 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CENPCQ03188 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CENPCQ03188 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CENPCQ03188 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CENPCQ03188 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CENPCQ03188 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CENPCQ03188 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CENPCQ03188 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CENPCQ03188 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CENPCQ03188 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CENPCQ03188 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CENPCQ03188 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CENPCQ03188 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CENPCQ03188 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CENPCQ03188 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CENPCQ03188 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CENPCQ03188 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CENPCQ03188 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CENPCQ03188 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CENPCQ03188 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CENPCQ03188 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CENPCQ03188 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CENPCQ03188 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CENPCQ03188 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CENPCQ03188 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CENPCQ03188 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CENPCQ03188 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CENPCQ03188 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CENPCQ03188 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CENPCQ03188 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CENPCQ03188 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CENPCQ03188 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CENPCQ03188 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CENPCQ03188 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CENPCQ03188 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CENPCQ03188 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CENPCQ03188 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CENPCQ03188 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CENPCQ03188 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CENPCQ03188 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CENPCQ03188 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CENPCQ03188 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CENPCQ03188 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CENPCQ03188 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CENPCQ03188 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CENPCQ03188 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CENPCQ03188 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CENPCQ03188 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CENPCQ03188 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CENPCQ03188 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CENPCQ03188 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CENPCQ03188 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CENPCQ03188 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CENPCQ03188 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CENPCQ03188 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CENPCQ03188 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CENPCQ03188 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CENPCQ03188 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CENPCQ03188 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CENPCQ03188 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CENPCQ03188 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CENPCQ03188 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CENPCQ03188 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CENPCQ03188 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CENPCQ03188 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CENPCQ03188 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CENPCQ03188 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CENPCQ03188 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CENPCQ03188 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CENPCQ03188 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CENPCQ03188 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CENPCQ03188 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CENPCQ03188 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CENPCQ03188 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CENPCQ03188 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CENPCQ03188 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CENPCQ03188 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CENPCQ03188 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CENPCQ03188 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CENPCQ03188 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CENPCQ03188 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CENPCQ03188 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CENPCQ03188 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CENPCQ03188 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CENPCQ03188 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CENPCQ03188 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CENPCQ03188 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CENPCQ03188 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CENPCQ03188 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CENPCQ03188 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CENPCQ03188 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CENPCQ03188 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms