Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 AC093536.2-201ENST00000565257 1406 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 LINC00973-201ENST00000473756 962 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 AC123767.1-204ENST00000523523 273 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 AL121694.1-201ENST00000554253 671 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 AC073575.2-201ENST00000614212 627 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 KCNMB3-201ENST00000314235 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 C2orf76-201ENST00000334816 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 AL606534.1-201ENST00000439562 694 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 AC009652.1-201ENST00000528326 648 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 AC104984.3-201ENST00000581946 546 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 AC007494.2-201ENST00000563757 764 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 AC003956.1-201ENST00000598450 356 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 TIMM10-201ENST00000257245 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 DEFT1P-201ENST00000453425 496 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms