Protein–RNA interactions for Protein: Q02127

DHODH, Dihydroorotate dehydrogenase (quinone), mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHODHQ02127 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DHODHQ02127 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DHODHQ02127 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DHODHQ02127 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DHODHQ02127 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DHODHQ02127 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
DHODHQ02127 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DHODHQ02127 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DHODHQ02127 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DHODHQ02127 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DHODHQ02127 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DHODHQ02127 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DHODHQ02127 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DHODHQ02127 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DHODHQ02127 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DHODHQ02127 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DHODHQ02127 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DHODHQ02127 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DHODHQ02127 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DHODHQ02127 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DHODHQ02127 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DHODHQ02127 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DHODHQ02127 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DHODHQ02127 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DHODHQ02127 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DHODHQ02127 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
DHODHQ02127 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
DHODHQ02127 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DHODHQ02127 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DHODHQ02127 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DHODHQ02127 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
DHODHQ02127 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DHODHQ02127 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DHODHQ02127 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DHODHQ02127 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DHODHQ02127 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DHODHQ02127 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DHODHQ02127 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DHODHQ02127 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DHODHQ02127 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DHODHQ02127 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DHODHQ02127 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DHODHQ02127 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DHODHQ02127 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DHODHQ02127 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DHODHQ02127 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DHODHQ02127 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DHODHQ02127 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DHODHQ02127 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
DHODHQ02127 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DHODHQ02127 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DHODHQ02127 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DHODHQ02127 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DHODHQ02127 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DHODHQ02127 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DHODHQ02127 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DHODHQ02127 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DHODHQ02127 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DHODHQ02127 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DHODHQ02127 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DHODHQ02127 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DHODHQ02127 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DHODHQ02127 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DHODHQ02127 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DHODHQ02127 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DHODHQ02127 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DHODHQ02127 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DHODHQ02127 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DHODHQ02127 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DHODHQ02127 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DHODHQ02127 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DHODHQ02127 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
DHODHQ02127 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DHODHQ02127 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DHODHQ02127 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DHODHQ02127 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DHODHQ02127 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DHODHQ02127 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DHODHQ02127 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DHODHQ02127 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DHODHQ02127 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DHODHQ02127 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DHODHQ02127 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DHODHQ02127 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DHODHQ02127 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DHODHQ02127 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DHODHQ02127 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DHODHQ02127 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DHODHQ02127 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
DHODHQ02127 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
DHODHQ02127 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DHODHQ02127 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DHODHQ02127 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DHODHQ02127 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DHODHQ02127 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DHODHQ02127 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DHODHQ02127 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DHODHQ02127 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DHODHQ02127 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DHODHQ02127 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms