Protein–RNA interactions for Protein: Q01201

RELB, Transcription factor RelB, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELBQ01201 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RELBQ01201 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RELBQ01201 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RELBQ01201 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RELBQ01201 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RELBQ01201 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RELBQ01201 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RELBQ01201 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RELBQ01201 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RELBQ01201 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RELBQ01201 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RELBQ01201 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RELBQ01201 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RELBQ01201 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RELBQ01201 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RELBQ01201 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RELBQ01201 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RELBQ01201 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RELBQ01201 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RELBQ01201 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RELBQ01201 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RELBQ01201 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RELBQ01201 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RELBQ01201 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RELBQ01201 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RELBQ01201 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RELBQ01201 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RELBQ01201 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RELBQ01201 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RELBQ01201 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RELBQ01201 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RELBQ01201 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RELBQ01201 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RELBQ01201 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RELBQ01201 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RELBQ01201 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RELBQ01201 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RELBQ01201 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RELBQ01201 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RELBQ01201 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RELBQ01201 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RELBQ01201 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RELBQ01201 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RELBQ01201 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RELBQ01201 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RELBQ01201 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RELBQ01201 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RELBQ01201 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RELBQ01201 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RELBQ01201 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RELBQ01201 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RELBQ01201 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RELBQ01201 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RELBQ01201 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RELBQ01201 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RELBQ01201 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RELBQ01201 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RELBQ01201 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RELBQ01201 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RELBQ01201 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RELBQ01201 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RELBQ01201 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RELBQ01201 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RELBQ01201 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RELBQ01201 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RELBQ01201 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RELBQ01201 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RELBQ01201 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RELBQ01201 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RELBQ01201 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RELBQ01201 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RELBQ01201 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RELBQ01201 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RELBQ01201 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RELBQ01201 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RELBQ01201 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RELBQ01201 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RELBQ01201 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RELBQ01201 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RELBQ01201 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RELBQ01201 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RELBQ01201 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RELBQ01201 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RELBQ01201 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RELBQ01201 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RELBQ01201 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RELBQ01201 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RELBQ01201 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RELBQ01201 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RELBQ01201 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RELBQ01201 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RELBQ01201 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RELBQ01201 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RELBQ01201 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RELBQ01201 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RELBQ01201 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RELBQ01201 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RELBQ01201 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RELBQ01201 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RELBQ01201 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms