Protein–RNA interactions for Protein: Q00888

PSG4, Pregnancy-specific beta-1-glycoprotein 4, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSG4Q00888 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSG4Q00888 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSG4Q00888 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSG4Q00888 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSG4Q00888 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSG4Q00888 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSG4Q00888 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSG4Q00888 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSG4Q00888 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSG4Q00888 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSG4Q00888 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSG4Q00888 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSG4Q00888 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSG4Q00888 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSG4Q00888 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSG4Q00888 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSG4Q00888 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSG4Q00888 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PSG4Q00888 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSG4Q00888 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSG4Q00888 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSG4Q00888 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSG4Q00888 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSG4Q00888 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSG4Q00888 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PSG4Q00888 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSG4Q00888 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSG4Q00888 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSG4Q00888 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSG4Q00888 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSG4Q00888 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSG4Q00888 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSG4Q00888 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSG4Q00888 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSG4Q00888 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSG4Q00888 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSG4Q00888 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSG4Q00888 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSG4Q00888 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSG4Q00888 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSG4Q00888 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PSG4Q00888 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PSG4Q00888 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PSG4Q00888 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PSG4Q00888 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PSG4Q00888 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PSG4Q00888 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PSG4Q00888 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PSG4Q00888 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PSG4Q00888 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PSG4Q00888 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PSG4Q00888 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PSG4Q00888 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PSG4Q00888 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PSG4Q00888 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PSG4Q00888 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PSG4Q00888 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PSG4Q00888 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PSG4Q00888 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PSG4Q00888 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PSG4Q00888 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PSG4Q00888 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PSG4Q00888 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PSG4Q00888 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PSG4Q00888 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PSG4Q00888 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PSG4Q00888 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PSG4Q00888 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PSG4Q00888 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PSG4Q00888 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PSG4Q00888 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSG4Q00888 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSG4Q00888 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSG4Q00888 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSG4Q00888 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSG4Q00888 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSG4Q00888 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSG4Q00888 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSG4Q00888 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSG4Q00888 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSG4Q00888 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSG4Q00888 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSG4Q00888 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSG4Q00888 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSG4Q00888 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSG4Q00888 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSG4Q00888 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSG4Q00888 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSG4Q00888 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSG4Q00888 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSG4Q00888 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSG4Q00888 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSG4Q00888 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSG4Q00888 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSG4Q00888 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSG4Q00888 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSG4Q00888 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSG4Q00888 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSG4Q00888 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSG4Q00888 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms