Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP2C1P98194 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP2C1P98194 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP2C1P98194 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP2C1P98194 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP2C1P98194 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP2C1P98194 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP2C1P98194 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP2C1P98194 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP2C1P98194 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP2C1P98194 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP2C1P98194 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP2C1P98194 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP2C1P98194 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP2C1P98194 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP2C1P98194 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP2C1P98194 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP2C1P98194 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP2C1P98194 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP2C1P98194 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP2C1P98194 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP2C1P98194 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP2C1P98194 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP2C1P98194 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP2C1P98194 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP2C1P98194 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP2C1P98194 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP2C1P98194 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP2C1P98194 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP2C1P98194 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP2C1P98194 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP2C1P98194 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP2C1P98194 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP2C1P98194 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP2C1P98194 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP2C1P98194 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP2C1P98194 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP2C1P98194 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP2C1P98194 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP2C1P98194 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP2C1P98194 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP2C1P98194 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP2C1P98194 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP2C1P98194 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP2C1P98194 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP2C1P98194 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP2C1P98194 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP2C1P98194 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP2C1P98194 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP2C1P98194 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP2C1P98194 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP2C1P98194 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP2C1P98194 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP2C1P98194 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP2C1P98194 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP2C1P98194 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP2C1P98194 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP2C1P98194 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP2C1P98194 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP2C1P98194 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP2C1P98194 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP2C1P98194 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP2C1P98194 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP2C1P98194 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP2C1P98194 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP2C1P98194 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP2C1P98194 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP2C1P98194 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP2C1P98194 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP2C1P98194 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP2C1P98194 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP2C1P98194 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP2C1P98194 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP2C1P98194 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP2C1P98194 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP2C1P98194 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP2C1P98194 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP2C1P98194 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP2C1P98194 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP2C1P98194 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP2C1P98194 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP2C1P98194 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP2C1P98194 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP2C1P98194 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP2C1P98194 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP2C1P98194 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP2C1P98194 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP2C1P98194 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP2C1P98194 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP2C1P98194 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP2C1P98194 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP2C1P98194 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP2C1P98194 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP2C1P98194 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP2C1P98194 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP2C1P98194 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP2C1P98194 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP2C1P98194 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP2C1P98194 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP2C1P98194 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms