Protein–RNA interactions for Protein: P78424

POU6F2, POU domain, class 6, transcription factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU6F2P78424 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
POU6F2P78424 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
POU6F2P78424 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
POU6F2P78424 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
POU6F2P78424 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
POU6F2P78424 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POU6F2P78424 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POU6F2P78424 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POU6F2P78424 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POU6F2P78424 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POU6F2P78424 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POU6F2P78424 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POU6F2P78424 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POU6F2P78424 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POU6F2P78424 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POU6F2P78424 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POU6F2P78424 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POU6F2P78424 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
POU6F2P78424 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POU6F2P78424 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POU6F2P78424 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POU6F2P78424 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
POU6F2P78424 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POU6F2P78424 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POU6F2P78424 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POU6F2P78424 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POU6F2P78424 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POU6F2P78424 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POU6F2P78424 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
POU6F2P78424 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
POU6F2P78424 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POU6F2P78424 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POU6F2P78424 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POU6F2P78424 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POU6F2P78424 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POU6F2P78424 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POU6F2P78424 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POU6F2P78424 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POU6F2P78424 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POU6F2P78424 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POU6F2P78424 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POU6F2P78424 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POU6F2P78424 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POU6F2P78424 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POU6F2P78424 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POU6F2P78424 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POU6F2P78424 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POU6F2P78424 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POU6F2P78424 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POU6F2P78424 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POU6F2P78424 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POU6F2P78424 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POU6F2P78424 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
POU6F2P78424 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POU6F2P78424 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POU6F2P78424 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POU6F2P78424 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POU6F2P78424 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POU6F2P78424 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POU6F2P78424 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POU6F2P78424 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POU6F2P78424 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POU6F2P78424 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POU6F2P78424 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POU6F2P78424 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POU6F2P78424 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POU6F2P78424 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POU6F2P78424 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POU6F2P78424 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POU6F2P78424 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POU6F2P78424 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POU6F2P78424 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POU6F2P78424 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POU6F2P78424 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POU6F2P78424 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POU6F2P78424 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POU6F2P78424 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POU6F2P78424 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POU6F2P78424 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POU6F2P78424 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POU6F2P78424 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POU6F2P78424 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POU6F2P78424 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POU6F2P78424 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POU6F2P78424 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POU6F2P78424 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POU6F2P78424 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POU6F2P78424 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POU6F2P78424 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POU6F2P78424 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POU6F2P78424 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POU6F2P78424 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POU6F2P78424 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POU6F2P78424 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POU6F2P78424 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
POU6F2P78424 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
POU6F2P78424 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POU6F2P78424 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POU6F2P78424 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POU6F2P78424 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms