Protein–RNA interactions for Protein: P78412

IRX6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX6P78412 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
IRX6P78412 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
IRX6P78412 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
IRX6P78412 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
IRX6P78412 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
IRX6P78412 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
IRX6P78412 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
IRX6P78412 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
IRX6P78412 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
IRX6P78412 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
IRX6P78412 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
IRX6P78412 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
IRX6P78412 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
IRX6P78412 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
IRX6P78412 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
IRX6P78412 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
IRX6P78412 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
IRX6P78412 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
IRX6P78412 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
IRX6P78412 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
IRX6P78412 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
IRX6P78412 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
IRX6P78412 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
IRX6P78412 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
IRX6P78412 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
IRX6P78412 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
IRX6P78412 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
IRX6P78412 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
IRX6P78412 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
IRX6P78412 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
IRX6P78412 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
IRX6P78412 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
IRX6P78412 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
IRX6P78412 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
IRX6P78412 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
IRX6P78412 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
IRX6P78412 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
IRX6P78412 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
IRX6P78412 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
IRX6P78412 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
IRX6P78412 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
IRX6P78412 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
IRX6P78412 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
IRX6P78412 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
IRX6P78412 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
IRX6P78412 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
IRX6P78412 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
IRX6P78412 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
IRX6P78412 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
IRX6P78412 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
IRX6P78412 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
IRX6P78412 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
IRX6P78412 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
IRX6P78412 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
IRX6P78412 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
IRX6P78412 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
IRX6P78412 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
IRX6P78412 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
IRX6P78412 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
IRX6P78412 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
IRX6P78412 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
IRX6P78412 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
IRX6P78412 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
IRX6P78412 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
IRX6P78412 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
IRX6P78412 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
IRX6P78412 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
IRX6P78412 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
IRX6P78412 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
IRX6P78412 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
IRX6P78412 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
IRX6P78412 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
IRX6P78412 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
IRX6P78412 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
IRX6P78412 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
IRX6P78412 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
IRX6P78412 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
IRX6P78412 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
IRX6P78412 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
IRX6P78412 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
IRX6P78412 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
IRX6P78412 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
IRX6P78412 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
IRX6P78412 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
IRX6P78412 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
IRX6P78412 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
IRX6P78412 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
IRX6P78412 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
IRX6P78412 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
IRX6P78412 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
IRX6P78412 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
IRX6P78412 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
IRX6P78412 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
IRX6P78412 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
IRX6P78412 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
IRX6P78412 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
IRX6P78412 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
IRX6P78412 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
IRX6P78412 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
IRX6P78412 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms