Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MCCD1P59942 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MCCD1P59942 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MCCD1P59942 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MCCD1P59942 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MCCD1P59942 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MCCD1P59942 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MCCD1P59942 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MCCD1P59942 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MCCD1P59942 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MCCD1P59942 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MCCD1P59942 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MCCD1P59942 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MCCD1P59942 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MCCD1P59942 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MCCD1P59942 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MCCD1P59942 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MCCD1P59942 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
MCCD1P59942 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MCCD1P59942 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MCCD1P59942 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MCCD1P59942 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MCCD1P59942 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MCCD1P59942 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MCCD1P59942 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MCCD1P59942 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MCCD1P59942 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MCCD1P59942 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MCCD1P59942 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MCCD1P59942 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MCCD1P59942 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MCCD1P59942 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MCCD1P59942 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MCCD1P59942 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MCCD1P59942 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MCCD1P59942 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MCCD1P59942 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MCCD1P59942 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MCCD1P59942 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MCCD1P59942 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MCCD1P59942 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MCCD1P59942 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MCCD1P59942 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
MCCD1P59942 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MCCD1P59942 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MCCD1P59942 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MCCD1P59942 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
MCCD1P59942 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MCCD1P59942 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MCCD1P59942 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MCCD1P59942 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MCCD1P59942 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MCCD1P59942 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MCCD1P59942 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MCCD1P59942 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MCCD1P59942 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MCCD1P59942 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MCCD1P59942 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MCCD1P59942 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MCCD1P59942 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MCCD1P59942 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MCCD1P59942 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MCCD1P59942 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MCCD1P59942 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MCCD1P59942 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MCCD1P59942 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MCCD1P59942 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MCCD1P59942 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MCCD1P59942 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MCCD1P59942 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MCCD1P59942 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MCCD1P59942 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MCCD1P59942 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MCCD1P59942 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MCCD1P59942 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MCCD1P59942 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MCCD1P59942 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MCCD1P59942 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MCCD1P59942 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MCCD1P59942 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MCCD1P59942 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MCCD1P59942 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MCCD1P59942 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MCCD1P59942 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MCCD1P59942 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MCCD1P59942 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MCCD1P59942 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MCCD1P59942 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
MCCD1P59942 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MCCD1P59942 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
MCCD1P59942 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MCCD1P59942 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MCCD1P59942 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MCCD1P59942 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MCCD1P59942 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MCCD1P59942 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MCCD1P59942 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MCCD1P59942 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MCCD1P59942 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MCCD1P59942 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms