Protein–RNA interactions for Protein: P57729

RAB38, Ras-related protein Rab-38, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB38P57729 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB38P57729 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB38P57729 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB38P57729 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB38P57729 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB38P57729 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB38P57729 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB38P57729 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB38P57729 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB38P57729 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB38P57729 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB38P57729 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB38P57729 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB38P57729 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB38P57729 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB38P57729 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB38P57729 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB38P57729 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB38P57729 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB38P57729 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB38P57729 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB38P57729 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB38P57729 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB38P57729 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB38P57729 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB38P57729 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB38P57729 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB38P57729 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB38P57729 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB38P57729 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB38P57729 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB38P57729 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB38P57729 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB38P57729 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB38P57729 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB38P57729 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB38P57729 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB38P57729 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB38P57729 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB38P57729 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB38P57729 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB38P57729 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB38P57729 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB38P57729 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB38P57729 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB38P57729 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB38P57729 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB38P57729 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB38P57729 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB38P57729 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB38P57729 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB38P57729 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB38P57729 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB38P57729 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB38P57729 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB38P57729 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB38P57729 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB38P57729 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB38P57729 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB38P57729 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB38P57729 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB38P57729 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB38P57729 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB38P57729 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB38P57729 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB38P57729 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB38P57729 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB38P57729 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB38P57729 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB38P57729 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB38P57729 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB38P57729 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB38P57729 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB38P57729 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB38P57729 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB38P57729 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB38P57729 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB38P57729 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB38P57729 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB38P57729 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB38P57729 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB38P57729 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB38P57729 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB38P57729 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB38P57729 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB38P57729 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB38P57729 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB38P57729 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB38P57729 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB38P57729 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB38P57729 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB38P57729 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB38P57729 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB38P57729 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB38P57729 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB38P57729 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB38P57729 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB38P57729 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB38P57729 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB38P57729 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms