Protein–RNA interactions for Protein: P56693

SOX10, Transcription factor SOX-10, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX10P56693 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SOX10P56693 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SOX10P56693 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SOX10P56693 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SOX10P56693 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SOX10P56693 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SOX10P56693 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SOX10P56693 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SOX10P56693 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SOX10P56693 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SOX10P56693 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SOX10P56693 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SOX10P56693 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SOX10P56693 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SOX10P56693 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SOX10P56693 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SOX10P56693 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SOX10P56693 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SOX10P56693 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SOX10P56693 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SOX10P56693 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SOX10P56693 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SOX10P56693 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SOX10P56693 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SOX10P56693 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SOX10P56693 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SOX10P56693 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SOX10P56693 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SOX10P56693 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SOX10P56693 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SOX10P56693 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SOX10P56693 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SOX10P56693 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SOX10P56693 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SOX10P56693 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SOX10P56693 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SOX10P56693 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SOX10P56693 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SOX10P56693 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SOX10P56693 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SOX10P56693 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SOX10P56693 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SOX10P56693 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SOX10P56693 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SOX10P56693 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SOX10P56693 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SOX10P56693 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SOX10P56693 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SOX10P56693 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SOX10P56693 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SOX10P56693 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SOX10P56693 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SOX10P56693 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SOX10P56693 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SOX10P56693 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SOX10P56693 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SOX10P56693 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SOX10P56693 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SOX10P56693 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SOX10P56693 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SOX10P56693 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SOX10P56693 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SOX10P56693 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SOX10P56693 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SOX10P56693 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SOX10P56693 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SOX10P56693 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SOX10P56693 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SOX10P56693 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SOX10P56693 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SOX10P56693 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SOX10P56693 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SOX10P56693 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SOX10P56693 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SOX10P56693 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SOX10P56693 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SOX10P56693 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SOX10P56693 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SOX10P56693 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SOX10P56693 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SOX10P56693 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SOX10P56693 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SOX10P56693 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SOX10P56693 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SOX10P56693 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SOX10P56693 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SOX10P56693 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SOX10P56693 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SOX10P56693 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SOX10P56693 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SOX10P56693 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SOX10P56693 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SOX10P56693 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SOX10P56693 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SOX10P56693 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SOX10P56693 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SOX10P56693 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SOX10P56693 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SOX10P56693 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SOX10P56693 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms