Protein–RNA interactions for Protein: P56524

HDAC4, Histone deacetylase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,084 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC4P56524 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HDAC4P56524 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HDAC4P56524 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HDAC4P56524 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HDAC4P56524 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HDAC4P56524 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HDAC4P56524 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HDAC4P56524 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HDAC4P56524 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HDAC4P56524 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HDAC4P56524 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HDAC4P56524 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HDAC4P56524 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HDAC4P56524 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HDAC4P56524 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HDAC4P56524 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HDAC4P56524 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HDAC4P56524 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HDAC4P56524 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HDAC4P56524 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HDAC4P56524 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HDAC4P56524 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HDAC4P56524 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HDAC4P56524 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HDAC4P56524 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HDAC4P56524 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HDAC4P56524 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HDAC4P56524 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HDAC4P56524 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HDAC4P56524 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HDAC4P56524 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HDAC4P56524 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HDAC4P56524 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HDAC4P56524 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HDAC4P56524 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HDAC4P56524 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HDAC4P56524 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HDAC4P56524 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HDAC4P56524 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HDAC4P56524 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HDAC4P56524 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HDAC4P56524 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HDAC4P56524 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HDAC4P56524 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
HDAC4P56524 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HDAC4P56524 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HDAC4P56524 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HDAC4P56524 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HDAC4P56524 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HDAC4P56524 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HDAC4P56524 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
HDAC4P56524 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HDAC4P56524 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HDAC4P56524 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HDAC4P56524 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HDAC4P56524 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HDAC4P56524 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HDAC4P56524 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HDAC4P56524 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HDAC4P56524 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HDAC4P56524 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HDAC4P56524 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HDAC4P56524 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HDAC4P56524 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HDAC4P56524 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HDAC4P56524 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
HDAC4P56524 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HDAC4P56524 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HDAC4P56524 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HDAC4P56524 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HDAC4P56524 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HDAC4P56524 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HDAC4P56524 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HDAC4P56524 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
HDAC4P56524 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
HDAC4P56524 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HDAC4P56524 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HDAC4P56524 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HDAC4P56524 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HDAC4P56524 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HDAC4P56524 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HDAC4P56524 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HDAC4P56524 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HDAC4P56524 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HDAC4P56524 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HDAC4P56524 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HDAC4P56524 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HDAC4P56524 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HDAC4P56524 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HDAC4P56524 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HDAC4P56524 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HDAC4P56524 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HDAC4P56524 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
HDAC4P56524 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HDAC4P56524 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HDAC4P56524 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HDAC4P56524 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HDAC4P56524 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HDAC4P56524 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HDAC4P56524 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms