Protein–RNA interactions for Protein: P55201

BRPF1, Peregrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF1P55201 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BRPF1P55201 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BRPF1P55201 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BRPF1P55201 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BRPF1P55201 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BRPF1P55201 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BRPF1P55201 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BRPF1P55201 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BRPF1P55201 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BRPF1P55201 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
BRPF1P55201 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BRPF1P55201 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BRPF1P55201 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
BRPF1P55201 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BRPF1P55201 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BRPF1P55201 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BRPF1P55201 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BRPF1P55201 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BRPF1P55201 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BRPF1P55201 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BRPF1P55201 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BRPF1P55201 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BRPF1P55201 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BRPF1P55201 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BRPF1P55201 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BRPF1P55201 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BRPF1P55201 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BRPF1P55201 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BRPF1P55201 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
BRPF1P55201 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
BRPF1P55201 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BRPF1P55201 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
BRPF1P55201 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
BRPF1P55201 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BRPF1P55201 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
BRPF1P55201 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
BRPF1P55201 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
BRPF1P55201 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
BRPF1P55201 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
BRPF1P55201 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BRPF1P55201 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC25■■□□□ 1.59
BRPF1P55201 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
BRPF1P55201 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
BRPF1P55201 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BRPF1P55201 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
BRPF1P55201 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
BRPF1P55201 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
BRPF1P55201 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
BRPF1P55201 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BRPF1P55201 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
BRPF1P55201 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BRPF1P55201 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BRPF1P55201 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BRPF1P55201 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BRPF1P55201 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BRPF1P55201 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BRPF1P55201 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BRPF1P55201 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BRPF1P55201 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BRPF1P55201 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BRPF1P55201 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BRPF1P55201 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BRPF1P55201 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
BRPF1P55201 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BRPF1P55201 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BRPF1P55201 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
BRPF1P55201 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BRPF1P55201 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
BRPF1P55201 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BRPF1P55201 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BRPF1P55201 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BRPF1P55201 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BRPF1P55201 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BRPF1P55201 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BRPF1P55201 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BRPF1P55201 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BRPF1P55201 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BRPF1P55201 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BRPF1P55201 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BRPF1P55201 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BRPF1P55201 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
BRPF1P55201 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BRPF1P55201 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BRPF1P55201 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BRPF1P55201 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BRPF1P55201 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BRPF1P55201 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BRPF1P55201 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BRPF1P55201 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BRPF1P55201 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BRPF1P55201 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BRPF1P55201 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
BRPF1P55201 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BRPF1P55201 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BRPF1P55201 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BRPF1P55201 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BRPF1P55201 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BRPF1P55201 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BRPF1P55201 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BRPF1P55201 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms