Protein–RNA interactions for Protein: P52294

KPNA1, Importin subunit alpha-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA1P52294 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KPNA1P52294 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KPNA1P52294 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KPNA1P52294 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KPNA1P52294 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KPNA1P52294 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KPNA1P52294 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KPNA1P52294 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
KPNA1P52294 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KPNA1P52294 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
KPNA1P52294 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KPNA1P52294 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KPNA1P52294 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
KPNA1P52294 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KPNA1P52294 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KPNA1P52294 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KPNA1P52294 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KPNA1P52294 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KPNA1P52294 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KPNA1P52294 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
KPNA1P52294 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KPNA1P52294 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KPNA1P52294 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KPNA1P52294 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KPNA1P52294 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KPNA1P52294 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KPNA1P52294 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
KPNA1P52294 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KPNA1P52294 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KPNA1P52294 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KPNA1P52294 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KPNA1P52294 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KPNA1P52294 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KPNA1P52294 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KPNA1P52294 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KPNA1P52294 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KPNA1P52294 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KPNA1P52294 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
KPNA1P52294 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KPNA1P52294 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KPNA1P52294 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KPNA1P52294 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KPNA1P52294 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
KPNA1P52294 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KPNA1P52294 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KPNA1P52294 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KPNA1P52294 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KPNA1P52294 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KPNA1P52294 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KPNA1P52294 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KPNA1P52294 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
KPNA1P52294 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KPNA1P52294 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KPNA1P52294 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KPNA1P52294 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
KPNA1P52294 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
KPNA1P52294 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KPNA1P52294 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KPNA1P52294 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KPNA1P52294 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KPNA1P52294 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KPNA1P52294 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KPNA1P52294 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KPNA1P52294 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KPNA1P52294 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KPNA1P52294 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KPNA1P52294 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
KPNA1P52294 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KPNA1P52294 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
KPNA1P52294 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KPNA1P52294 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KPNA1P52294 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KPNA1P52294 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KPNA1P52294 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KPNA1P52294 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KPNA1P52294 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KPNA1P52294 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KPNA1P52294 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
KPNA1P52294 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KPNA1P52294 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KPNA1P52294 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KPNA1P52294 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KPNA1P52294 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KPNA1P52294 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KPNA1P52294 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
KPNA1P52294 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KPNA1P52294 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KPNA1P52294 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KPNA1P52294 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
KPNA1P52294 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KPNA1P52294 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KPNA1P52294 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KPNA1P52294 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KPNA1P52294 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KPNA1P52294 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KPNA1P52294 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KPNA1P52294 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KPNA1P52294 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KPNA1P52294 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KPNA1P52294 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms